More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2525 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
352 aa  707    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2174  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.82 
 
 
364 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2773  histidine kinase  59.08 
 
 
374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2930  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  57.76 
 
 
352 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00193882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5743  histidine kinase  51.54 
 
 
357 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.022107  hitchhiker  0.000697261 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6826  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.58 
 
 
379 aa  361  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.04 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439065  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4369  histidine kinase  54.18 
 
 
361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5050  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.18 
 
 
361 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.18 
 
 
361 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352763  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05453  transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  55.62 
 
 
360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.74 
 
 
361 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693923  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.29 
 
 
367 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00300746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1791  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.86 
 
 
358 aa  329  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.813908  normal  0.38268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3051  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.3 
 
 
361 aa  318  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606131  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.82 
 
 
357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 
368 aa  305  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2736  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 
368 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
358 aa  269  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
360 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3781  hypothetical protein  39.71 
 
 
360 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.02 
 
 
512 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3132  histidine kinase  36.25 
 
 
402 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.752444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
425 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  34.94 
 
 
423 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
518 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  35.24 
 
 
518 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  36.58 
 
 
463 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  36.63 
 
 
593 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.78 
 
 
457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3085  sensor histidine kinase  35.14 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.389389  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.45 
 
 
460 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  37.46 
 
 
359 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3224  histidine kinase  32.32 
 
 
389 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
458 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.45 
 
 
461 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.09 
 
 
455 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.11 
 
 
461 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.11 
 
 
461 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  30.19 
 
 
364 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  35.61 
 
 
473 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  30.19 
 
 
364 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  26.81 
 
 
310 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  26.23 
 
 
473 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
493 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
451 aa  155  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
454 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  32.53 
 
 
516 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
467 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
451 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.11 
 
 
453 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.94 
 
 
467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.94 
 
 
467 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.94 
 
 
467 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.94 
 
 
467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0122  histidine kinase  30.65 
 
 
392 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.58 
 
 
467 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.57 
 
 
467 aa  152  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
488 aa  152  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.97 
 
 
467 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.82 
 
 
467 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.45 
 
 
467 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
507 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.57 
 
 
470 aa  149  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  33.45 
 
 
467 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  33.45 
 
 
467 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.45 
 
 
467 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  33.45 
 
 
467 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.45 
 
 
467 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
473 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
471 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  30.42 
 
 
482 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.09 
 
 
467 aa  146  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.22 
 
 
465 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.85 
 
 
452 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04835  two-component system sensor protein  32.64 
 
 
397 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  25.54 
 
 
467 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
383 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  34.75 
 
 
391 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  30.95 
 
 
518 aa  143  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
476 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
453 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
382 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  28.52 
 
 
464 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.41 
 
 
463 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
364 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  32.49 
 
 
480 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
471 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
358 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2693  histidine kinase  29.39 
 
 
399 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.751419  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  30.36 
 
 
455 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
396 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
389 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
458 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  34.97 
 
 
592 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
483 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  28.67 
 
 
471 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>