More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0113 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
302 aa  599  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  44.76 
 
 
313 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
314 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.22 
 
 
313 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0546452  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
314 aa  245  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
308 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
315 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
322 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
322 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
322 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
306 aa  236  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
320 aa  235  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
318 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.56 
 
 
314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.965219  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 
313 aa  232  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.99 
 
 
314 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  40.77 
 
 
315 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.4 
 
 
321 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488375  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2679  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.06 
 
 
314 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0387434  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.21 
 
 
339 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.86 
 
 
315 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
334 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 
315 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0708639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 
313 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
317 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  41.83 
 
 
336 aa  225  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
316 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00994535  normal  0.14386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
313 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
313 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
316 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
319 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  43.51 
 
 
313 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.79 
 
 
313 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.48 
 
 
313 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  39.87 
 
 
339 aa  222  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
319 aa  222  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
313 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  40.45 
 
 
351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
314 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
313 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6476  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  43.31 
 
 
316 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4576  peptide ABC transporter permease  38.57 
 
 
318 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752948  hitchhiker  0.00438876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
334 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
313 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  41.05 
 
 
298 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
313 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.77 
 
 
308 aa  218  7.999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
333 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.26 
 
 
314 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 
313 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
315 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  36.93 
 
 
306 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  36.93 
 
 
306 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  36.93 
 
 
306 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.93 
 
 
306 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.61 
 
 
312 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.882657  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
333 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  37.93 
 
 
316 aa  216  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
315 aa  215  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.93 
 
 
306 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
313 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.13 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  40.52 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  40.2 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  39.02 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  40.13 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673833  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4538  peptide ABC transporter, permease protein  42.55 
 
 
315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  41.87 
 
 
316 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.4 
 
 
315 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  39.48 
 
 
339 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  40.13 
 
 
339 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  40.13 
 
 
339 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1299  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.91 
 
 
307 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.56 
 
 
321 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000414077  hitchhiker  0.00173265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
313 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  40.13 
 
 
339 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  39.54 
 
 
336 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  39.48 
 
 
339 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  40.13 
 
 
339 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  40.13 
 
 
339 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  39.74 
 
 
337 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
334 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  39.16 
 
 
339 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
316 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  39.81 
 
 
339 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>