125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0190 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0369  Stringent starvation protein B  100 
 
 		 141 aa  289  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.539363  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0190  stringent starvation protein B  100 
 
 		 141 aa  289  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0129  stringent starvation protein B  43.61 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0907  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.53 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1001  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.86 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1406  ClpXP protease specificity-enhancing factor  50.98 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0139  Stringent starvation protein B  45.52 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.253376  normal  0.0968579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3636  Stringent starvation protein B  52.53 
 
 		 165 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177806  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2105  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.84 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.054144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0463  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.01 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13100  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.73 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0295  ClpXP protease specificity-enhancing factor  52.53 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0748969  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3089  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.51 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3663  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.163839  normal  0.173019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03088  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0478  Stringent starvation protein B  49.49 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4545  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00795203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03039  hypothetical protein  49.49 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00302867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3417  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3710  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1131  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.15 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000374711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0527  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.15 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0478  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000881621  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0302  ClpXP protease specificity-enhancing factor  51.58 
 
 		 167 aa  104  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0800734  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3548  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2207  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.7 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3226  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.48 
 
 		 165 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3523  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.48 
 
 		 165 aa  103  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000608482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1941  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.65 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1876  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.93 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3639  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0402989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3701  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3534  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0546582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00341096  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3604  ClpXP protease specificity-enhancing factor  49.49 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0530098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5499  stringent starvation protein B  49.5 
 
 		 176 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00437  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.48 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4423  stringent starvation protein B  47.96 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219018  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1829  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.48 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.183406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2855  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.27 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.408921 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3794  Stringent starvation protein B  49.49 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0488524  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2925  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.37 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57520  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.48 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4999  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.48 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3159  ClpXP protease specificity-enhancing factor  41.79 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3697  stringent starvation protein B  40.71 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.449226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0928  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.9 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4117  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.94 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0255  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.41 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.262631  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1938  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.41 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552634  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3540  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.71 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.190354  normal  0.0891932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3202  ClpXP protease specificity-enhancing factor  37.04 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  0.769041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4688  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.19 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170007  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2968  ClpXP protease specificity-enhancing factor  47.42 
 
 		 175 aa  98.6  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.816462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0418  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.69 
 
 		 169 aa  98.6  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0853  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.04 
 
 		 178 aa  98.6  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4346  ClpXP protease specificity-enhancing factor  48.48 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00332207  hitchhiker  0.00737983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1321  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1958  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.69 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.188367  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2739  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.02 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4403  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.88 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2973  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.39 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3646  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.39 
 
 		 173 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3703  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.39 
 
 		 173 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4528  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.86 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.36 
 
 		 173 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0127228  hitchhiker  0.00000353694 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2694  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.39 
 
 		 175 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.843962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3671  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.39 
 
 		 175 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240699  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3543  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.36 
 
 		 175 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2662  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.36 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.467258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0363  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.36 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143816  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0445  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.36 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3260  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.39 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3931  stringent starvation protein B  43.12 
 
 		 176 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1809  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.39 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2744  ClpXP protease specificity-enhancing factor  46.39 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0372  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45.36 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.785538 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1424  ClpXP protease specificity-enhancing factor  34.25 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.214233  normal  0.191438 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2629  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.35 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0755  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.95 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0556951  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3692  stringent starvation protein B  47 
 
 		 199 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1204  Stringent starvation protein B  42.74 
 
 		 197 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0348  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.33 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2756  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.35 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2466  ClpXP protease specificity-enhancing factor  40 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1365  ClpXP protease specificity-enhancing factor  38.82 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0264  stringent starvation protein B  36.5 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119829  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1587  ClpXP protease specificity-enhancing factor  34.31 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0756  Stringent starvation protein B  44.54 
 
 		 175 aa  93.6  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0793  stringent starvation protein B  44.86 
 
 		 178 aa  94  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24426  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0792  ClpXP protease specificity-enhancing factor  35.04 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.198285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0825  ClpXP protease specificity-enhancing factor  44.33 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0574  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.43 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.07602  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0109  ClpXP protease specificity-enhancing factor  39.73 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3532  ClpXP protease specificity-enhancing factor  43.16 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0753  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.42 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.749535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0934  ClpXP protease specificity-enhancing factor  45 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03199  stringent starvation protein B  37.5 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000635662  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0813  ClpXP protease specificity-enhancing factor  42.27 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284281  hitchhiker  0.000260876 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2204  stringent starvation protein B  39.55 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>