294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0205 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0205  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 288 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0183  prephenate dehydrogenase  97.79 
 
 		 288 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0194  Prephenate dehydrogenase  97.79 
 
 		 288 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0203  prephenate dehydrogenase  78.33 
 
 		 285 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.503225  hitchhiker  0.00431893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  36.91 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  35.74 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.84 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.36 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  35.4 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.23 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  31.9 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  31.9 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  35.87 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.08 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  31.74 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  37.33 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  36.51 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  31.97 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.99 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.4 
 
 		 746 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  34.82 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.78 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.96 
 
 		 311 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.96 
 
 		 311 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  29.07 
 
 		 367 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  37.33 
 
 		 312 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  32.97 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  36.88 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  36.94 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  34.5 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  34.05 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  33.7 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  25.82 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.77 
 
 		 746 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  29.86 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  32.11 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 		 373 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.74 
 
 		 310 aa  95.9  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  32.88 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  32.88 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2051  Prephenate dehydrogenase  27.07 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.129678  decreased coverage  0.0000000000498492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.3 
 
 		 311 aa  95.5  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  33.07 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.35 
 
 		 307 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  35.38 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 		 366 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  33.96 
 
 		 328 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  31.5 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  34.18 
 
 		 534 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  34.21 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.86 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.95 
 
 		 310 aa  92  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  28.85 
 
 		 369 aa  92  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.47 
 
 		 746 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  24.82 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  28.63 
 
 		 378 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  29.24 
 
 		 366 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.47 
 
 		 746 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  28.63 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  28.63 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  34.08 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  32.49 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 		 364 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  35.32 
 
 		 323 aa  90.1  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  32.49 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.47 
 
 		 746 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  28.21 
 
 		 366 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  26.27 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  28.21 
 
 		 366 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  28.21 
 
 		 366 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  33.94 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  31.53 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  27.13 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  27.78 
 
 		 366 aa  89  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  25.27 
 
 		 280 aa  89.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.29 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  32.88 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  24.82 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  28.21 
 
 		 378 aa  89  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.7 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1832  Prephenate dehydrogenase  31.67 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  32.37 
 
 		 379 aa  88.6  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  31.98 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  29.7 
 
 		 278 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.08 
 
 		 735 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.45 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.79 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  30.29 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  34.36 
 
 		 367 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>