71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0019 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0019    100 
 
 		 330 bp  654    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  100 
 
 		 1116 bp  133  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  100 
 
 		 1800 bp  131  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  100 
 
 		 1941 bp  131  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  100 
 
 		 1806 bp  131  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  97.01 
 
 		 1221 bp  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77329  component of SWI/SNF global activator complex  100 
 
 		 3666 bp  107  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0231889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2775  hypothetical protein  93.94 
 
 		 195 bp  99.6  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.720264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07190  conserved hypothetical protein  93.85 
 
 		 5783 bp  97.6  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5157  hypothetical protein  100 
 
 		 1239 bp  93.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00100  ubiquitin-specific protease, putative  93.65 
 
 		 3796 bp  93.7  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0377728  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00360  hypothetical protein  96.23 
 
 		 4387 bp  89.7  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30535  SWI5-like zinc finger protein  92.06 
 
 		 1563 bp  85.7  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.688222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2190  hypothetical protein  100 
 
 		 240 bp  77.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.172006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1550  hypothetical protein  100 
 
 		 186 bp  75.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.611696  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00951  putative b-zip transcription factor (Eurofung)  89.23 
 
 		 6154 bp  73.8  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0984135 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01170  expressed protein  89.23 
 
 		 3273 bp  73.8  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03660  hypothetical protein  95.45 
 
 		 3062 bp  71.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.480177  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47197  Ark-family serine/threonine protein kinase  88.41 
 
 		 3192 bp  69.9  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.691529 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65402  predicted protein  92.16 
 
 		 3431 bp  69.9  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.609736  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4088  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  89.66 
 
 		 2004 bp  67.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346982  normal  0.644971 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02310  hypothetical protein  88.71 
 
 		 3411 bp  67.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.22008  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67949  predicted protein  87.88 
 
 		 3250 bp  67.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.4792 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  89.47 
 
 		 18219 bp  65.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28393  histone acetyltransferase SAGA complex member  93.33 
 
 		 2364 bp  65.9  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67383  predicted protein  87.69 
 
 		 5100 bp  65.9  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.852681  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08076  MYB DNA-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01730)  88.33 
 
 		 6164 bp  63.9  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.335364 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04720  hypothetical protein  87.88 
 
 		 3962 bp  63.9  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0670767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  91.67 
 
 		 1044 bp  63.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  97.14 
 
 		 2529 bp  61.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  88.14 
 
 		 4983 bp  61.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78645  predicted protein  91.49 
 
 		 3137 bp  61.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_006686  CND06400  TAF15, putative  88.14 
 
 		 3742 bp  61.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67626  zinc finger protein  86.36 
 
 		 2452 bp  60  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.482303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88332  DNA-binding transcription factor  87.1 
 
 		 1473 bp  60  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67937  Protein involved in regulation of cell size putative RNA binding protein  90 
 
 		 3530 bp  60  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.900945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  97.06 
 
 		 2613 bp  60  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66259  predicted protein  90 
 
 		 1247 bp  60  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07474  RNA binding protein Jsn1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05610)  94.74 
 
 		 3596 bp  60  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.54562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  86.36 
 
 		 1689 bp  60  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 1167 bp  58  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00153  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  91.11 
 
 		 2754 bp  58  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00290  cyclin-dependent protein kinase, putative  92.68 
 
 		 2326 bp  58  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  89.58 
 
 		 2502 bp  56  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67409  predicted protein  100 
 
 		 1331 bp  54  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.975027  normal  0.411701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4317  hypothetical protein  89.36 
 
 		 198 bp  54  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03940  kinase, putative  94.29 
 
 		 3174 bp  54  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02650  hypothetical protein  86.44 
 
 		 2369 bp  54  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82631  predicted protein  92.11 
 
 		 1864 bp  52  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.293318 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03834  conserved hypothetical protein  88 
 
 		 2634 bp  52  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  100 
 
 		 1860 bp  52  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  89.13 
 
 		 2826 bp  52  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66436  Protein required for nuclear import with some similarity to Nsr1p, another protein involved in nuclear transport  92.11 
 
 		 2736 bp  52  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06972  serine-leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02230)  84.62 
 
 		 1383 bp  50.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02320  cytoplasm protein, putative  89.36 
 
 		 3750 bp  50.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69971  predicted protein  88.64 
 
 		 6192 bp  48.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1157  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  86.54 
 
 		 6765 bp  48.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67102  predicted protein  85 
 
 		 3881 bp  48.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66613  predicted protein  89.13 
 
 		 2414 bp  48.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67071  predicted protein  90.48 
 
 		 2329 bp  48.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.775435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66227  Nuclear receptor coregulator SMRT/SMRTER, contains Myb-like domains  100 
 
 		 2481 bp  46.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.271146 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31200  predicted protein  84.62 
 
 		 2127 bp  46.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.645088  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05709  conserved hypothetical protein  87.23 
 
 		 1844 bp  46.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00693682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0818  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 2304 bp  46.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2116  acyl carrier protein  100 
 
 		 285 bp  46.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02070  hypothetical protein  91.43 
 
 		 4083 bp  46.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5184  spore coat protein GerQ  93.55 
 
 		 438 bp  46.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03730  cytoplasm protein, putative  91.43 
 
 		 3575 bp  46.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  100 
 
 		 2508 bp  46.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  91.43 
 
 		 13407 bp  46.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  91.43 
 
 		 13719 bp  46.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>