More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2454 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 272 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  61.11 
 
 		 294 aa  322  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  56.34 
 
 		 281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  53.36 
 
 		 282 aa  301  6.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  57.75 
 
 		 261 aa  298  6e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  50.58 
 
 		 270 aa  280  1e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  53.26 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  48.61 
 
 		 247 aa  239  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  46.95 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  42.32 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  39.68 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  36.47 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  39.1 
 
 		 261 aa  162  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  34.91 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  39.69 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  36.64 
 
 		 265 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  38.04 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  38.49 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  33.46 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  32.96 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  36.98 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  37.15 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  34.96 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  33.08 
 
 		 266 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  35.9 
 
 		 276 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  36.84 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  34.87 
 
 		 283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  33.46 
 
 		 266 aa  132  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  39.66 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  33.21 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  33.98 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  36.75 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  37.39 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  37.39 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  37.45 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  37.09 
 
 		 263 aa  109  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  37.13 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  34.91 
 
 		 341 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  37.17 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  36.54 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  38.5 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  35.53 
 
 		 373 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  30.95 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  33.33 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  31.05 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  34.67 
 
 		 361 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  37.38 
 
 		 373 aa  99.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  30.71 
 
 		 338 aa  99  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  37.1 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0061  ATP synthase F0 subunit A  35.4 
 
 		 339 aa  97.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  30.2 
 
 		 340 aa  94.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  32.37 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  32.05 
 
 		 391 aa  92.8  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  34.48 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  32.74 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  34.39 
 
 		 247 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  36.32 
 
 		 251 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  35.24 
 
 		 406 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  32.13 
 
 		 303 aa  92  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  35.11 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  35.59 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  33.82 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  32.52 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  34.47 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  33.91 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  34.19 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  34.45 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  31.08 
 
 		 243 aa  90.5  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  30.26 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  35.87 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  35.78 
 
 		 384 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  35.07 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  34.96 
 
 		 376 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  32.7 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  34.65 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  35.02 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  33.62 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  34.42 
 
 		 194 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.29 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  34.17 
 
 		 400 aa  85.5  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  30.29 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  33.02 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  33.75 
 
 		 250 aa  85.5  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  30.95 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  32.43 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  31.89 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1304  ATP synthase F0, A subunit  32.68 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000065102  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  31.98 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2522  F0F1 ATP synthase subunit A  29.37 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145329  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  35.11 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  30.84 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00428  F0F1 ATP synthase subunit A  30.47 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  32.76 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  30.41 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  34.07 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>