170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1839 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1839  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
416 aa  789    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  41.08 
 
 
402 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  42.03 
 
 
406 aa  229  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  40.25 
 
 
406 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  32.37 
 
 
402 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  34.08 
 
 
385 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0897  sodium/hydrogen exchanger  34.39 
 
 
398 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 
401 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0334  sodium/hydrogen exchanger  32.12 
 
 
378 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.3 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  24.3 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1900  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 
557 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000133298 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 
609 aa  110  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00880  Kef-type K+ transport system, membrane component  33.74 
 
 
402 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.57 
 
 
608 aa  99  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  24.04 
 
 
614 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  24.03 
 
 
609 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.54 
 
 
609 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  23.54 
 
 
609 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  23.54 
 
 
609 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.54 
 
 
609 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.54 
 
 
609 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.54 
 
 
609 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.3 
 
 
609 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  23.92 
 
 
611 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.54 
 
 
609 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.3 
 
 
609 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 
389 aa  84  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  22.12 
 
 
614 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  22.12 
 
 
614 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  24.47 
 
 
375 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  23.54 
 
 
609 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  23.76 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  24.73 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  24.73 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  24.73 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  24.73 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  24.73 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  25.08 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  24.1 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.73 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  27.41 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  24.37 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  26.28 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.47 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.37 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.83 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.83 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.14 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.14 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.83 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.83 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  25 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
482 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.14 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  24.44 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  24.48 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  24.44 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  24.44 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  26.04 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  22.47 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  22.52 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  23 
 
 
388 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  26.55 
 
 
715 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 
703 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  23.53 
 
 
392 aa  60.8  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  22.38 
 
 
386 aa  60.1  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 
386 aa  60.1  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  25.35 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0751  potassium efflux system protein  30.58 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  25.08 
 
 
719 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  23.58 
 
 
767 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 
425 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  26.03 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  22.32 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  24.51 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  23.78 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.53 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  24.26 
 
 
397 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0747  potassium efflux system protein  28.52 
 
 
398 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  26.62 
 
 
533 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  24.92 
 
 
404 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  25.56 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  22.96 
 
 
423 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 
667 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  21.28 
 
 
390 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  25.35 
 
 
395 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0713  potassium efflux system protein  28.11 
 
 
398 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  24.52 
 
 
747 aa  50.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 
414 aa  50.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 
667 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  22.94 
 
 
756 aa  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  20.14 
 
 
404 aa  50.1  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 
415 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  25.45 
 
 
663 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  29.35 
 
 
602 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 
402 aa  49.7  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  25.45 
 
 
669 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>