More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1889 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 402 aa  769    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  51.28 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  51.87 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  44.44 
 
 		 401 aa  276  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  42.67 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0897  sodium/hydrogen exchanger  43.89 
 
 		 398 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1839  sodium/hydrogen exchanger  39.69 
 
 		 416 aa  233  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  39.84 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00880  Kef-type K+ transport system, membrane component  37.76 
 
 		 402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1900  sodium/hydrogen exchanger  35.99 
 
 		 557 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000133298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0334  sodium/hydrogen exchanger  36.55 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.42 
 
 		 609 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  25.36 
 
 		 609 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.18 
 
 		 609 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  25.06 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.42 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.18 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  25.18 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  25.18 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.18 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.18 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 611 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.57 
 
 		 484 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.18 
 
 		 609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  23.35 
 
 		 614 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.39 
 
 		 608 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  25.6 
 
 		 609 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  23.46 
 
 		 614 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  23.46 
 
 		 614 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  22.49 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.79 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.48 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.48 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.1 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.17 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  21.84 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  27.12 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  27.46 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  27.96 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  27.96 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  25.86 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  26.78 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.78 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.43 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  31.67 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  23.29 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  25.65 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  23.02 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  26.74 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  26.89 
 
 		 392 aa  67  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2396  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0747  potassium efflux system protein  33.58 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.01 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0751  potassium efflux system protein  33.58 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  24.23 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  24.11 
 
 		 660 aa  63.9  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1031  sodium/hydrogen exchanger  26.19 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.819756  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  23.89 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.89 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  23.89 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0168  Sodium/hydrogen exchanger  23.31 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  23.89 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  24.64 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  23.89 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  24.23 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  24.23 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  26.12 
 
 		 597 aa  63.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.16 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  25.08 
 
 		 767 aa  62.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  29.97 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  29.47 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  24.18 
 
 		 660 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  24.77 
 
 		 756 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  29.72 
 
 		 613 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  19.56 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  25.63 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 		 747 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  21.88 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  23.92 
 
 		 649 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1067  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.23 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000268693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  22.88 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  24.65 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1212  potassium efflux system protein  26.63 
 
 		 603 aa  60.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212928  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0713  potassium efflux system protein  32.35 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  27.67 
 
 		 628 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  27.27 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  23.98 
 
 		 649 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  25.66 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>