265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0341 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
401 aa  748    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  44.44 
 
 
402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  46.39 
 
 
402 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 
406 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  44.36 
 
 
406 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0897  sodium/hydrogen exchanger  46.41 
 
 
398 aa  232  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  42.67 
 
 
385 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1839  sodium/hydrogen exchanger  34.06 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212345  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00880  Kef-type K+ transport system, membrane component  37.3 
 
 
402 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1900  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
557 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000133298 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 
609 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0334  sodium/hydrogen exchanger  36.97 
 
 
378 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  26.34 
 
 
614 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.32 
 
 
608 aa  126  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 
611 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  25.32 
 
 
614 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  25.32 
 
 
614 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.88 
 
 
609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.88 
 
 
609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  24.88 
 
 
609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  24.88 
 
 
609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.88 
 
 
609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 
609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  25.12 
 
 
609 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.88 
 
 
609 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.38 
 
 
609 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.63 
 
 
609 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  32.2 
 
 
389 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  24.58 
 
 
484 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.94 
 
 
484 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  24.5 
 
 
609 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  26.3 
 
 
375 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  26.3 
 
 
375 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.3 
 
 
375 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  26.3 
 
 
375 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  26.3 
 
 
375 aa  87  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  26.26 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  25.95 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  25.4 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  25.4 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25.08 
 
 
375 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.33 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  25.08 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.33 
 
 
387 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.33 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  29.65 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.33 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  26.33 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.33 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  26.33 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  29.39 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  25.34 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  23.95 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  26.3 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.3 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  26.3 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.36 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  26.52 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  23.15 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  24.62 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  25.99 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1852  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.52 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  21.96 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  24.83 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1676  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.26 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.86 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.77 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  24.66 
 
 
388 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2056  sodium/hydrogen exchanger family protein  25 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 
389 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  25.34 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1549  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.76 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.43 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  24.66 
 
 
756 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0168  Sodium/hydrogen exchanger  26.64 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  26.64 
 
 
482 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  23.71 
 
 
396 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0747  potassium efflux system protein  28.22 
 
 
398 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  20.8 
 
 
530 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1031  sodium/hydrogen exchanger  25.59 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.819756  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3951  potassium efflux system protein  35.29 
 
 
657 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.959395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  27.53 
 
 
674 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 
415 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 
703 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  24.35 
 
 
399 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  22.25 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0751  potassium efflux system protein  27.64 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5246  potassium efflux system protein  37.7 
 
 
595 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2815  potassium efflux system protein  32.89 
 
 
632 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 
722 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5301  potassium efflux system protein  37.7 
 
 
595 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.805136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>