113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0177 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  100 
 
 
388 aa  754    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  55.93 
 
 
389 aa  436  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1549  sodium/hydrogen exchanger family protein  56.99 
 
 
387 aa  429  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  56.68 
 
 
387 aa  410  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1676  sodium/hydrogen exchanger family protein  50.13 
 
 
391 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2056  sodium/hydrogen exchanger family protein  50.39 
 
 
391 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1852  sodium/hydrogen exchanger family protein  50.13 
 
 
391 aa  365  1e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  49.2 
 
 
392 aa  362  6e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0168  Sodium/hydrogen exchanger  48.02 
 
 
387 aa  351  1e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  44.38 
 
 
382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  41.05 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  26.55 
 
 
389 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  28.27 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 
611 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  27.89 
 
 
614 aa  89.7  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  24.5 
 
 
614 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  24.5 
 
 
614 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  24.5 
 
 
609 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.22 
 
 
608 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 
609 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.18 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  24.18 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  24.18 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.18 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.18 
 
 
609 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.18 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  25.32 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.81 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.18 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  24.43 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.94 
 
 
609 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  24.54 
 
 
484 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.54 
 
 
484 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  24.77 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  27.12 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  24.33 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1900  sodium/hydrogen exchanger  34.88 
 
 
557 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000133298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  22.58 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  23.86 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  21.89 
 
 
395 aa  57  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  25.45 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1839  sodium/hydrogen exchanger  22.97 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212345  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  24.56 
 
 
406 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  21.4 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  22.01 
 
 
387 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  21.05 
 
 
387 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 
406 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  22.65 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.37 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  21.98 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  20.7 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.93 
 
 
352 aa  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  21.66 
 
 
424 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  22.63 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  20.7 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  20.7 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  20.7 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  26.26 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  20.7 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  20.7 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  20.7 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  26.06 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 
400 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  22.03 
 
 
375 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  25 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  22.35 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  22.35 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  22.35 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  22.35 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  22.35 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0747  potassium efflux system protein  23.2 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  24.21 
 
 
412 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  22.35 
 
 
375 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  24.14 
 
 
385 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  22.26 
 
 
389 aa  47  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  25.77 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  23.9 
 
 
387 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  23.1 
 
 
585 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  21.84 
 
 
375 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  23.47 
 
 
586 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  21.84 
 
 
375 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  23.03 
 
 
586 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  21.01 
 
 
423 aa  46.2  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  21.16 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  23.62 
 
 
586 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  21.84 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  22.44 
 
 
585 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  25.57 
 
 
665 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  24.43 
 
 
722 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  26.01 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2766  sodium/hydrogen exchanger  23.68 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  22.07 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  23.3 
 
 
586 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  22.35 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  25.7 
 
 
530 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.18 
 
 
587 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  21.07 
 
 
424 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>