More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0713 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0713  potassium efflux system protein  100 
 
 
398 aa  759    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0751  potassium efflux system protein  95.73 
 
 
398 aa  685    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0747  potassium efflux system protein  97.49 
 
 
398 aa  716    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4470  potassium efflux system protein  87.19 
 
 
398 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  64.46 
 
 
613 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  62.47 
 
 
602 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  63.93 
 
 
613 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5156  potassium efflux system protein  63.57 
 
 
595 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.458112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5246  potassium efflux system protein  63.57 
 
 
595 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  62.56 
 
 
602 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5301  potassium efflux system protein  63.82 
 
 
595 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.805136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3513  potassium efflux system protein  64.94 
 
 
602 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0226  potassium efflux system protein  62.47 
 
 
595 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  47.52 
 
 
628 aa  312  7.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  47.52 
 
 
628 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  48.42 
 
 
616 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  48.59 
 
 
602 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  48.59 
 
 
602 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  48.59 
 
 
602 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  45.32 
 
 
602 aa  298  9e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  46.5 
 
 
605 aa  297  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  47.36 
 
 
601 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  47.35 
 
 
602 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  47.1 
 
 
601 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  47.1 
 
 
601 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  47.1 
 
 
601 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  47.72 
 
 
604 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  46.72 
 
 
601 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0210  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, putative  42.71 
 
 
635 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909712  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0190  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.71 
 
 
614 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3904  potassium efflux system protein  49.43 
 
 
595 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.738179  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  46.85 
 
 
596 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1666  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  47.17 
 
 
627 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  47.2 
 
 
598 aa  279  7e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4025  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  46.21 
 
 
603 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3845  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  46.33 
 
 
603 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  44.78 
 
 
620 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.78 
 
 
620 aa  276  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  44.78 
 
 
620 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.78 
 
 
620 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  44.78 
 
 
620 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.01 
 
 
620 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.78 
 
 
620 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.78 
 
 
620 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.78 
 
 
620 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.62 
 
 
621 aa  273  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  46.62 
 
 
601 aa  272  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507118  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.05 
 
 
604 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03201  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  46.97 
 
 
601 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0148329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0362  potassium efflux system protein  46.97 
 
 
601 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3547  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  46.97 
 
 
601 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000433295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.12 
 
 
620 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03153  hypothetical protein  46.97 
 
 
601 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3820  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  46.97 
 
 
601 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000303842  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.85 
 
 
620 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  42.23 
 
 
624 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.85 
 
 
620 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3632  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  46.72 
 
 
601 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0050352  hitchhiker  0.00031102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.85 
 
 
620 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3725  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  46.97 
 
 
601 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  45.45 
 
 
601 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.91 
 
 
600 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3041  potassium efflux system protein  42.09 
 
 
615 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.639601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3213  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  46.24 
 
 
602 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  43.38 
 
 
617 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  46.43 
 
 
605 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.59 
 
 
620 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  38.66 
 
 
631 aa  267  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  43.89 
 
 
589 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  43.89 
 
 
589 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0528  potassium efflux system protein  40.35 
 
 
604 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  44.29 
 
 
589 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  43.89 
 
 
589 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  42.89 
 
 
589 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002286  glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC  46.84 
 
 
598 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0420  potassium efflux system protein  41.15 
 
 
621 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.597186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  42.27 
 
 
624 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3340  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  41.62 
 
 
610 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  44.77 
 
 
607 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  45.74 
 
 
635 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0086  potassium efflux system protein  40.14 
 
 
633 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0904  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  41.6 
 
 
608 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5903  potassium efflux system protein  42.78 
 
 
588 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455929 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  42.71 
 
 
597 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1668  potassium efflux system protein  43.68 
 
 
610 aa  255  8e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.228254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1296  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  47.42 
 
 
605 aa  255  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00893714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1237  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  46.39 
 
 
608 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  44.29 
 
 
589 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0944  potassium efflux system protein  46.48 
 
 
610 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.728384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0368  potassium efflux system protein  42.79 
 
 
608 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  44.29 
 
 
589 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  39.79 
 
 
585 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0433  potassium efflux system protein  45.08 
 
 
599 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  39.8 
 
 
601 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  39.8 
 
 
601 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3951  potassium efflux system protein  45.79 
 
 
657 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.959395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1486  sodium/hydrogen exchanger  40.49 
 
 
622 aa  249  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.09304  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  43.61 
 
 
589 aa  249  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0406  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.95 
 
 
638 aa  249  9e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122767  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05273  hypothetical protein  41.58 
 
 
652 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>