More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0334 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0334  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 378 aa  724    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  37.38 
 
 		 402 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1900  sodium/hydrogen exchanger  37.31 
 
 		 557 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000133298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0897  sodium/hydrogen exchanger  39.77 
 
 		 398 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  37.24 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  36.34 
 
 		 401 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  35.49 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  35.37 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  34.78 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00880  Kef-type K+ transport system, membrane component  35.05 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1839  sodium/hydrogen exchanger  32.12 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212345  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 		 609 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.68 
 
 		 608 aa  123  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  27.18 
 
 		 614 aa  122  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 		 609 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  26.34 
 
 		 614 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  26.34 
 
 		 614 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.32 
 
 		 609 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.89 
 
 		 609 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  26.89 
 
 		 609 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  26.89 
 
 		 609 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.89 
 
 		 609 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.89 
 
 		 609 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  26.89 
 
 		 609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.89 
 
 		 609 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  27.07 
 
 		 609 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  25.49 
 
 		 484 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 611 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.09 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 609 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.8 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  31.61 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  26.74 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  25.35 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  25.35 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  25.35 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  25 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  25.65 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  26.06 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  25 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  25 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  25 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.15 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.79 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  24.79 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.51 
 
 		 605 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.52 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.92 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.92 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.92 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  27.92 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 630 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  27.92 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  23.7 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  25.66 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  26.49 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28 
 
 		 621 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  26.58 
 
 		 719 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.49 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  24.04 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.66 
 
 		 620 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.49 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  28.57 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  22.37 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  28.68 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  26.48 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.66 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 		 703 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  26.49 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  27.53 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.49 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.49 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0751  potassium efflux system protein  26.09 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.49 
 
 		 620 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.24 
 
 		 620 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.24 
 
 		 620 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  28.32 
 
 		 602 aa  63.2  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.53 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.41 
 
 		 620 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.41 
 
 		 620 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.41 
 
 		 620 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  25.36 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  26.35 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27 
 
 		 655 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0747  potassium efflux system protein  26.15 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  24.33 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0301  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  28.66 
 
 		 604 aa  60.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.768293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 		 595 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  26.13 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  24.88 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 		 629 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>