More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3643 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  79.92 
 
 		 259 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  81.85 
 
 		 259 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  79.54 
 
 		 259 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  78.76 
 
 		 259 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  76.74 
 
 		 260 aa  414  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  76.83 
 
 		 259 aa  414  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  71.71 
 
 		 261 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  70.47 
 
 		 264 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  67.84 
 
 		 261 aa  357  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  68.11 
 
 		 264 aa  350  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  66.13 
 
 		 267 aa  345  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  57.56 
 
 		 274 aa  289  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  49.61 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50 
 
 		 251 aa  269  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  53.95 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  54.13 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  49.22 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  48.25 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  54.55 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.81 
 
 		 263 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  51.17 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  56.22 
 
 		 304 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  53.72 
 
 		 304 aa  258  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  49.57 
 
 		 258 aa  258  8e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  51.18 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  51.5 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  52.84 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  49.4 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.16 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  51.22 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  56.87 
 
 		 303 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  55.2 
 
 		 303 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  55.2 
 
 		 303 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  50.2 
 
 		 315 aa  247  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  51.09 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  49.36 
 
 		 286 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  50.79 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.16 
 
 		 279 aa  244  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  47.95 
 
 		 286 aa  244  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.6 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  54.63 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 260 aa  242  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.82 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 278 aa  242  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  47.83 
 
 		 257 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  49.17 
 
 		 304 aa  241  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  49.37 
 
 		 288 aa  241  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  48.02 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.45 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 		 278 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  47.93 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.24 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48.35 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.63 
 
 		 280 aa  239  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49.6 
 
 		 287 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  52.12 
 
 		 282 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  50.43 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  51.77 
 
 		 267 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  51.1 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  49.59 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.37 
 
 		 263 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.69 
 
 		 258 aa  235  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  45.38 
 
 		 276 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  52.94 
 
 		 265 aa  235  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  43.9 
 
 		 267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 251 aa  234  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  48.48 
 
 		 249 aa  234  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  50.39 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  48.79 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  48.75 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  48.82 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  49.01 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  50.2 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  47.2 
 
 		 287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  47.04 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  44.88 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  47.78 
 
 		 295 aa  231  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.41 
 
 		 274 aa  231  7.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  49.78 
 
 		 272 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  46.83 
 
 		 293 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  53.33 
 
 		 259 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.44 
 
 		 269 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  49.12 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  47.2 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  48.19 
 
 		 272 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  49.12 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.12 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  48.68 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.75 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.85 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  46.8 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  48.54 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>