272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1789 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  493  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  66.24 
 
 
235 aa  322  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  58.37 
 
 
237 aa  287  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  56.44 
 
 
237 aa  278  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  55.51 
 
 
244 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  42.48 
 
 
241 aa  175  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  38.5 
 
 
226 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  34.7 
 
 
244 aa  155  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  38.91 
 
 
234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  39.35 
 
 
227 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  34.05 
 
 
246 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  34.05 
 
 
246 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  39.27 
 
 
227 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  37.1 
 
 
235 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  34.38 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  36.2 
 
 
224 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  31.97 
 
 
254 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  32.73 
 
 
238 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  35.27 
 
 
242 aa  141  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  34.65 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  32.72 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  32.74 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  36.04 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  35.91 
 
 
224 aa  139  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  33.46 
 
 
261 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  32.47 
 
 
233 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  36.87 
 
 
243 aa  135  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  34.76 
 
 
238 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  34.21 
 
 
234 aa  134  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  34.4 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  34.09 
 
 
252 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  29.88 
 
 
239 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  34.39 
 
 
223 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  34.88 
 
 
223 aa  128  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  34.23 
 
 
254 aa  125  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  31.58 
 
 
242 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  31.33 
 
 
265 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  30.04 
 
 
251 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  35 
 
 
242 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  31.22 
 
 
300 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  30.91 
 
 
301 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  31.53 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  31.22 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  30.77 
 
 
295 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  30.77 
 
 
295 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  30.32 
 
 
316 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  30.77 
 
 
303 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  30.77 
 
 
285 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  30.32 
 
 
295 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  30.7 
 
 
257 aa  118  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  30.13 
 
 
245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  34.3 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  34.56 
 
 
238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  33.95 
 
 
253 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  27.8 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  29.6 
 
 
241 aa  115  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  29.77 
 
 
241 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  33.49 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  28.64 
 
 
235 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  33.49 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  30.32 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  29.33 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  30.94 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  27.52 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  30.94 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  30.94 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  31.94 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  30.94 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  30.94 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  29.77 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  30.94 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  28.86 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  30.94 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  29 
 
 
288 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  27.97 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  27.97 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  28.64 
 
 
235 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  30.05 
 
 
278 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  29.11 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  28.18 
 
 
235 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  42.03 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  27.63 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  31.75 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  29.55 
 
 
481 aa  111  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  27.5 
 
 
308 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  31.11 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  27.63 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  29.77 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  27.31 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  28.18 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  28.18 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  29.58 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  27.52 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  28.18 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  27.86 
 
 
240 aa  109  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  31.49 
 
 
314 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  28.64 
 
 
240 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  27.73 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  31.53 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>