More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03174 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  100 
 
 
377 aa  758    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  98.41 
 
 
377 aa  748    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  75.53 
 
 
378 aa  584  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  70.03 
 
 
377 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  69.5 
 
 
377 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  67.9 
 
 
377 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  69.76 
 
 
377 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  69.76 
 
 
377 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  69.76 
 
 
377 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  67.2 
 
 
377 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  66.93 
 
 
379 aa  500  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  65.69 
 
 
402 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  66.58 
 
 
376 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  66.05 
 
 
375 aa  493  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  65.78 
 
 
376 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  64.02 
 
 
378 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  65.34 
 
 
379 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  64.06 
 
 
384 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  63.28 
 
 
384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  64.46 
 
 
376 aa  455  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  58.51 
 
 
385 aa  438  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  47.06 
 
 
374 aa  346  4e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  46.26 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  46.67 
 
 
387 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  46.46 
 
 
393 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  47.1 
 
 
394 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  42.72 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  41.63 
 
 
395 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  40.3 
 
 
392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  44.03 
 
 
319 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  43.88 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  40.26 
 
 
390 aa  245  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  40.26 
 
 
390 aa  245  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  40.68 
 
 
375 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  39.2 
 
 
388 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  39.32 
 
 
404 aa  235  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  39.33 
 
 
380 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  40 
 
 
376 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  37.83 
 
 
327 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  37.86 
 
 
356 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  64.44 
 
 
484 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  63.89 
 
 
485 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  36.61 
 
 
437 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  48.87 
 
 
492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  38.38 
 
 
386 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  35.32 
 
 
462 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  66.47 
 
 
468 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  36.47 
 
 
420 aa  215  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  36.13 
 
 
383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  36.57 
 
 
369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  36.57 
 
 
369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  64.67 
 
 
467 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  58.89 
 
 
488 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  34.86 
 
 
379 aa  212  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  62.13 
 
 
481 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  37.77 
 
 
274 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  60.36 
 
 
482 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  66.26 
 
 
516 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  64.42 
 
 
517 aa  206  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  38.28 
 
 
412 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  62.35 
 
 
687 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  35.18 
 
 
404 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  37.56 
 
 
373 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  36.25 
 
 
388 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  36.25 
 
 
388 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  36.25 
 
 
388 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  36.25 
 
 
388 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  36.25 
 
 
388 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  37.12 
 
 
390 aa  202  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  36.25 
 
 
388 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  36.25 
 
 
388 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  36.5 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  35.09 
 
 
384 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  35.09 
 
 
384 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  34.77 
 
 
387 aa  199  9e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  36.03 
 
 
422 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  35.7 
 
 
386 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  44.41 
 
 
494 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3587  flagellin domain-containing protein  36.95 
 
 
345 aa  196  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  55.43 
 
 
580 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  37.93 
 
 
288 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  35.93 
 
 
389 aa  192  6e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  35.1 
 
 
387 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  35.86 
 
 
388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  51.28 
 
 
276 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  54.89 
 
 
294 aa  189  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  55.68 
 
 
271 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 
271 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 
271 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  55.68 
 
 
271 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  44.9 
 
 
483 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  59.32 
 
 
272 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  51.56 
 
 
271 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  51.56 
 
 
271 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  58.49 
 
 
404 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  57.76 
 
 
272 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  57.76 
 
 
272 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  57.8 
 
 
274 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  53.25 
 
 
475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0834  flagellin domain-containing protein  39.46 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.9933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>