More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03171 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  100 
 
 
376 aa  750    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  94.15 
 
 
376 aa  712    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  82.45 
 
 
376 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  78.31 
 
 
377 aa  585  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  78.04 
 
 
377 aa  581  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  76.92 
 
 
377 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  76.92 
 
 
377 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  74.2 
 
 
402 aa  556  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  73.81 
 
 
377 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  72.15 
 
 
377 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  72.15 
 
 
375 aa  541  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  66.84 
 
 
378 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  65.78 
 
 
377 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  65.78 
 
 
377 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  65.7 
 
 
379 aa  487  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  64.46 
 
 
377 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  64.94 
 
 
384 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  64.32 
 
 
384 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  66.67 
 
 
379 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  61.44 
 
 
385 aa  474  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  62.5 
 
 
378 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  50.53 
 
 
374 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  50.8 
 
 
374 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  50.25 
 
 
393 aa  334  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  49.62 
 
 
394 aa  332  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  46.55 
 
 
387 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  41.45 
 
 
405 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  42.39 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  40.46 
 
 
392 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  44.15 
 
 
319 aa  256  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  44.27 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  39.22 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  40.72 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  40.72 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  38.1 
 
 
375 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  38.92 
 
 
404 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  65.87 
 
 
467 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  40.21 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  37.72 
 
 
383 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  68.94 
 
 
484 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  65.87 
 
 
468 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  37.47 
 
 
380 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  68.32 
 
 
485 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  64.6 
 
 
482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  65.22 
 
 
481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  35.42 
 
 
437 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  61.8 
 
 
517 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  38.62 
 
 
369 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  38.79 
 
 
386 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  38.62 
 
 
369 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  36.36 
 
 
431 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  36.79 
 
 
356 aa  210  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  59.88 
 
 
492 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  59.55 
 
 
516 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  39.37 
 
 
412 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  34.2 
 
 
420 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  62.11 
 
 
687 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  35.22 
 
 
386 aa  202  7e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  43.57 
 
 
488 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  35.25 
 
 
327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  37.12 
 
 
390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  33.83 
 
 
462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  37.28 
 
 
404 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  58.33 
 
 
494 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  34.38 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  34.44 
 
 
379 aa  195  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  36.62 
 
 
422 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 
271 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 
271 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  53.44 
 
 
271 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  50.99 
 
 
272 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  50.99 
 
 
272 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  53.44 
 
 
271 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  34.43 
 
 
384 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  53.44 
 
 
271 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  53.44 
 
 
271 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  34.43 
 
 
384 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  58.79 
 
 
274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  48.46 
 
 
483 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  58.02 
 
 
270 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  59.88 
 
 
274 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  56.29 
 
 
490 aa  189  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  54.91 
 
 
475 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  53.97 
 
 
493 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3588  flagellin domain-containing protein  33.92 
 
 
392 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  54.34 
 
 
475 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  34.99 
 
 
389 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  50.53 
 
 
273 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  58.02 
 
 
275 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  59.01 
 
 
294 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  57.06 
 
 
273 aa  185  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  54.82 
 
 
506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  57.41 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  53.71 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  51.61 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  51.34 
 
 
501 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  56.79 
 
 
271 aa  182  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  54.7 
 
 
273 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  56.79 
 
 
294 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  37.47 
 
 
287 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>