88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003102 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  95.66 
 
 
417 aa  833  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  84.3 
 
 
414 aa  748  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.292e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  88.89 
 
 
414 aa  787  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  100 
 
 
414 aa  863  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  73.51 
 
 
405 aa  642  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  48.25 
 
 
413 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  48.25 
 
 
413 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  47.67 
 
 
413 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  47.75 
 
 
426 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  47.25 
 
 
412 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  46.34 
 
 
413 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  5.77497e-06 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  47.75 
 
 
413 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  46.59 
 
 
412 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  47.75 
 
 
412 aa  379  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  46.27 
 
 
398 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  46.06 
 
 
414 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  46.06 
 
 
414 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  46.9 
 
 
396 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  45.73 
 
 
397 aa  373  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  47.03 
 
 
400 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  46.75 
 
 
412 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  46.78 
 
 
400 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  46.75 
 
 
412 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  46.91 
 
 
399 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  44.5 
 
 
409 aa  365  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  46.39 
 
 
396 aa  365  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  46.21 
 
 
399 aa  363  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  45.41 
 
 
401 aa  364  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  45.57 
 
 
399 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  45.32 
 
 
399 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  46.48 
 
 
401 aa  362  7e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.42738e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  46.02 
 
 
396 aa  362  8e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  45.34 
 
 
405 aa  362  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  45 
 
 
403 aa  358  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  45.71 
 
 
405 aa  358  9e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  43.32 
 
 
402 aa  358  1e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  45.36 
 
 
395 aa  357  2e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  44.28 
 
 
394 aa  357  3e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  43.03 
 
 
401 aa  357  3e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  44.36 
 
 
392 aa  356  4e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  45.25 
 
 
399 aa  355  6e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  44.95 
 
 
398 aa  355  7e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  45.2 
 
 
397 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.68136e-06 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  44.95 
 
 
398 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  45.3 
 
 
399 aa  353  3e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  45.2 
 
 
398 aa  352  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  45.45 
 
 
407 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  41.83 
 
 
401 aa  344  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  44.59 
 
 
403 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  41.87 
 
 
403 aa  340  2e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  4.18334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  44.24 
 
 
399 aa  339  6e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.84986e-15 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  41.83 
 
 
401 aa  338  7e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  43.95 
 
 
404 aa  337  2e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  43.1 
 
 
422 aa  337  2e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  6.59439e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  40.64 
 
 
403 aa  337  3e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  42.82 
 
 
424 aa  336  4e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  41.34 
 
 
401 aa  336  4e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  42.26 
 
 
424 aa  336  5e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  43.1 
 
 
399 aa  336  5e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  41.09 
 
 
401 aa  335  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  43.98 
 
 
398 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  43.86 
 
 
398 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  39.42 
 
 
404 aa  328  1e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  40.93 
 
 
405 aa  325  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  30.88 
 
 
407 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  32.11 
 
 
403 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  29.68 
 
 
408 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  29.43 
 
 
407 aa  167  3e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  29.43 
 
 
407 aa  167  3e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  29.43 
 
 
407 aa  167  3e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  30.84 
 
 
401 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  22.77 
 
 
398 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  24.38 
 
 
415 aa  82  2e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  25.43 
 
 
385 aa  77.8  3e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  22.61 
 
 
403 aa  64.7  3e-09  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.06 
 
 
367 aa  60.8  4e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  23.35 
 
 
378 aa  54.3  4e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  22.31 
 
 
384 aa  53.1  8e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  22.42 
 
 
384 aa  52.4  1e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  23.37 
 
 
394 aa  51.2  3e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  21.98 
 
 
394 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  21.98 
 
 
394 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  21.98 
 
 
394 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  21.98 
 
 
394 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  25.44 
 
 
369 aa  47  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  21.45 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  21.45 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  21.25 
 
 
394 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>