More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002640 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  42.27 
 
 		 530 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  40.82 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  47.42 
 
 		 515 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  39.8 
 
 		 537 aa  82.4  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  39.8 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  46.88 
 
 		 513 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 548 aa  79  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3661  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0868  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3531  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0893  putative HTH-type regulatory protein, AraC family  36.36 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.364356  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  34.58 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 492 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1419  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  37.96 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 342 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2506  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 303 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 526 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 550 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4249  DNA-binding response regulator  30.83 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 600 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05185  hypothetical protein  35.48 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4407  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3855  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3944  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4513  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001306  putative ARAC-type regulatory protein  35.48 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4396  DNA-binding response regulator  30.83 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4237  DNA-binding response regulator  30.83 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5791  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4614  DNA-binding response regulator  30.83 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4736  DNA-binding response regulator  30.83 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  33.94 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  33.94 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 544 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.71 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3979  two component transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 324 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.14 
 
 		 415 aa  68.6  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 519 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 324 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.58 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0342  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 778 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  35.71 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 345 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  33.65 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>