More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0778 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  100 
 
 		 98 aa  202  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3402  ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 159 aa  84.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301569  normal  0.342869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  43.88 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  43.88 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  43.88 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  41.05 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1526  ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.506351  normal  0.0309301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2389  ribosomal protein S6  40.38 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  40.82 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  46.32 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  41.24 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  46.32 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  41.84 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  41.24 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  40.21 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  41.49 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  40.21 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  39.58 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  37.11 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  40 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  39.18 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_917  ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000118903  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1046  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000381184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0929  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  37.11 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  35.71 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  38.14 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  37.11 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  35.92 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  32.32 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  31.96 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  26.8 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  31.63 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  27.55 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  34.95 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  29.59 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>