More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2787 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2787  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
331 aa  641    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4881  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.12 
 
 
320 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.75 
 
 
323 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3202  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  36.31 
 
 
323 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4715  putative 2-nitropropane dioxygenase  40 
 
 
333 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.56 
 
 
316 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4537  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.05 
 
 
318 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262388  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  35.02 
 
 
317 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.82 
 
 
315 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5156  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.95 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10021  hypothetical protein  40.49 
 
 
322 aa  146  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.62 
 
 
313 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.3 
 
 
316 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8517  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.8 
 
 
326 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.12 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.82 
 
 
338 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4936  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.72 
 
 
492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.121654 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  31.58 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.02 
 
 
360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.23 
 
 
325 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.47 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.58 
 
 
319 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3841  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.23 
 
 
506 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278341  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.78 
 
 
312 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.93 
 
 
316 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.58 
 
 
326 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1242  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40 
 
 
295 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3114  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.93 
 
 
492 aa  126  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0206  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.98 
 
 
348 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.04 
 
 
354 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1082  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.43 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6053  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.65 
 
 
341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.96 
 
 
320 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.2 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38755  predicted protein  32.72 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1215  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.13 
 
 
295 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1232  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.13 
 
 
295 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.86313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.78 
 
 
311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.8 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.57 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  31.1 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3191  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.1 
 
 
492 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.05 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2480  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.7 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459764  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.12 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.12 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.1 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.34 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.82 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.23 
 
 
359 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.69 
 
 
358 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.23 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.45 
 
 
364 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 
354 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.42 
 
 
309 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.49 
 
 
350 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  35 
 
 
383 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.42 
 
 
329 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  32.6 
 
 
359 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.79 
 
 
351 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.45 
 
 
335 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.96 
 
 
361 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.86 
 
 
378 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.08 
 
 
316 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.46 
 
 
356 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.19 
 
 
361 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.46 
 
 
356 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.38 
 
 
355 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.05 
 
 
321 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.38 
 
 
355 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  31.37 
 
 
318 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.44 
 
 
342 aa  103  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.97 
 
 
366 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.96 
 
 
376 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.82 
 
 
374 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.82 
 
 
374 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.49 
 
 
317 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.38 
 
 
313 aa  102  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.96 
 
 
350 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.43 
 
 
323 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.76 
 
 
376 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.85 
 
 
371 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  38.33 
 
 
370 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.43 
 
 
355 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13586  oxidoreductase  30.99 
 
 
355 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00804869  normal  0.19405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.38 
 
 
362 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  30.79 
 
 
311 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.83 
 
 
313 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.41 
 
 
374 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.97 
 
 
344 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  27.56 
 
 
314 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1141  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.33 
 
 
338 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.487634  normal  0.166905 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3754  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.73 
 
 
354 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.1 
 
 
378 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.64 
 
 
334 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.53 
 
 
356 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.53 
 
 
356 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.53 
 
 
356 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.31 
 
 
331 aa  99.4  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>