More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1956 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 520 aa  997    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  57.11 
 
 		 519 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12278  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD1  59.03 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3759  FAD dependent oxidoreductase  56.49 
 
 		 517 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1796  FAD dependent oxidoreductase  59.53 
 
 		 518 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00246275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.05 
 
 		 522 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2239  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.06 
 
 		 502 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.126564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 		 508 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6684  FAD dependent oxidoreductase  57.27 
 
 		 516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414435  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  57.55 
 
 		 538 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4592  FAD dependent oxidoreductase  54.95 
 
 		 523 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00758706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0304  FAD dependent oxidoreductase  57.54 
 
 		 511 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0184959  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2773  FAD dependent oxidoreductase  56.86 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114338  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3372  FAD dependent oxidoreductase  56.88 
 
 		 518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.581331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3383  FAD dependent oxidoreductase  56.88 
 
 		 518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.918838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3434  FAD dependent oxidoreductase  56.88 
 
 		 518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0941  FAD dependent oxidoreductase  54.88 
 
 		 555 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0194279  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4837  FAD dependent oxidoreductase  56.6 
 
 		 510 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5410  FAD dependent oxidoreductase  51.52 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  39.16 
 
 		 559 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  39.08 
 
 		 559 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.41 
 
 		 525 aa  264  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 566 aa  262  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 		 560 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  38.54 
 
 		 574 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.8 
 
 		 585 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  39.56 
 
 		 603 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 		 562 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 583 aa  249  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  40.08 
 
 		 543 aa  249  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  35.34 
 
 		 525 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  40.72 
 
 		 557 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 559 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 572 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  39.61 
 
 		 600 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  40.2 
 
 		 532 aa  243  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 		 595 aa  243  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 582 aa  243  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 		 579 aa  243  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 532 aa  242  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.06 
 
 		 605 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 524 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 639 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.32 
 
 		 537 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 		 579 aa  240  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 582 aa  240  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  39.23 
 
 		 519 aa  239  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 		 573 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 537 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.85 
 
 		 567 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  38.31 
 
 		 567 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 552 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 		 603 aa  237  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 575 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 577 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 529 aa  236  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 582 aa  236  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.84 
 
 		 587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 		 574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  38.59 
 
 		 528 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 		 581 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.45 
 
 		 530 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 582 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.29 
 
 		 554 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  38.72 
 
 		 584 aa  233  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  35.91 
 
 		 545 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 519 aa  230  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 579 aa  229  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  37.39 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  38.58 
 
 		 559 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 546 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 569 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  40.12 
 
 		 582 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 		 542 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  39.35 
 
 		 517 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 		 568 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 		 519 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  37.06 
 
 		 585 aa  223  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 536 aa  223  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 573 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 		 579 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 		 579 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 593 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 		 579 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 		 534 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1035  FAD dependent oxidoreductase  38.82 
 
 		 556 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 539 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 		 543 aa  216  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.3 
 
 		 591 aa  215  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 		 583 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  38.4 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 520 aa  209  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 543 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 		 548 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 545 aa  207  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 		 581 aa  206  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>