192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1213 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
150 aa  308  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  62.94 
 
 
149 aa  174  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  62.59 
 
 
203 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  60.28 
 
 
149 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  61.27 
 
 
150 aa  168  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  64.06 
 
 
181 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  62.69 
 
 
145 aa  167  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  64.06 
 
 
181 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  63.97 
 
 
142 aa  167  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  64.06 
 
 
149 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  64.06 
 
 
149 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  64.06 
 
 
149 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  64.06 
 
 
149 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  60.74 
 
 
153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  62.69 
 
 
145 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  62.69 
 
 
145 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  58.87 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  61.94 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  58.99 
 
 
138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  60.14 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  60.43 
 
 
137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  57.04 
 
 
136 aa  160  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  60.45 
 
 
145 aa  159  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  60.45 
 
 
145 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  61.36 
 
 
153 aa  157  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  56.2 
 
 
142 aa  157  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  53.42 
 
 
143 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  64.17 
 
 
125 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  56.16 
 
 
188 aa  155  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 
164 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  55.3 
 
 
147 aa  154  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  57.78 
 
 
162 aa  153  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  59.09 
 
 
147 aa  153  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  55.97 
 
 
160 aa  153  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  57.78 
 
 
162 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  55.24 
 
 
143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  56.43 
 
 
147 aa  151  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  56.82 
 
 
147 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  57.94 
 
 
147 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  56.82 
 
 
155 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  59.09 
 
 
145 aa  148  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  55.32 
 
 
137 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  52.52 
 
 
144 aa  147  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  54.14 
 
 
143 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  55.3 
 
 
150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  51.43 
 
 
148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  51.43 
 
 
153 aa  143  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  47.55 
 
 
145 aa  144  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  51.82 
 
 
153 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
150 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  51.82 
 
 
153 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 
145 aa  140  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  47.37 
 
 
148 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  51.05 
 
 
156 aa  137  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  48.63 
 
 
155 aa  135  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  50.77 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  49.25 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  47.69 
 
 
150 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  50.77 
 
 
143 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  44.37 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  45.86 
 
 
149 aa  106  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  33.77 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  36.36 
 
 
151 aa  88.2  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
146 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  35.46 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  31.47 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  31.47 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
136 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  32.09 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  28.91 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  25.4 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  31.34 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  29.67 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  23.94 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  26.24 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 
135 aa  52  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  24.44 
 
 
142 aa  52  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>