66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0647 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
348 aa  689    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  72.41 
 
 
348 aa  541  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  75 
 
 
347 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  70.98 
 
 
346 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  32.14 
 
 
369 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  28.33 
 
 
384 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  29.36 
 
 
365 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  35.14 
 
 
385 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  32.86 
 
 
392 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  28.08 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  28.89 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  28.89 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  28.89 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  28.61 
 
 
366 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  28.61 
 
 
366 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  28.61 
 
 
366 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  27.98 
 
 
365 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  27.15 
 
 
365 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  28.06 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  31.45 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  29.46 
 
 
366 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  29.17 
 
 
366 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  29.46 
 
 
366 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  29.46 
 
 
366 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  29.46 
 
 
366 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  29.23 
 
 
376 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  27.86 
 
 
367 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  29.21 
 
 
367 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  32.11 
 
 
385 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  30.4 
 
 
373 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  29.89 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  28.03 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  31.62 
 
 
389 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  28.92 
 
 
392 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  30.36 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  31.62 
 
 
389 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  27.78 
 
 
376 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  28.92 
 
 
360 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  26.37 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  29.62 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  28.06 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  29.72 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  29.72 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  31.58 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  30.36 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  27.24 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  27.72 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 
387 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  28.39 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
388 aa  60.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  24.81 
 
 
444 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  23.11 
 
 
748 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  24.18 
 
 
450 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  25.75 
 
 
408 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  23.44 
 
 
403 aa  53.1  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  22.06 
 
 
439 aa  52.8  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  23.42 
 
 
456 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  21.61 
 
 
441 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3542  Saccharopine dehydrogenase  29.29 
 
 
382 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54890  hypothetical protein  33.11 
 
 
634 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000285931  unclonable  1.9973799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  21.54 
 
 
394 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  21.54 
 
 
394 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  21.54 
 
 
394 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  21.54 
 
 
394 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  21.54 
 
 
394 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>