More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0007 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0007  PUA domain-containing protein  100 
 
 
375 aa  766  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0665  PUA domain-containing protein  80 
 
 
376 aa  644  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.438806  normal  0.11367 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2171  PUA domain-containing protein  73.26 
 
 
375 aa  556  1e-157  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0010  PUA domain-containing protein  67.47 
 
 
377 aa  547  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0394  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.34 
 
 
398 aa  332  7e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0312752  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0494  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.17 
 
 
389 aa  233  4e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.201395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1346  Fmu (Sun) domain protein  36.16 
 
 
350 aa  217  3e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1617  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.85 
 
 
346 aa  192  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  33.92 
 
 
451 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  33.62 
 
 
451 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  29.87 
 
 
446 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  31.47 
 
 
452 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  29.73 
 
 
444 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  32.31 
 
 
457 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  29.21 
 
 
430 aa  94  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  34.78 
 
 
302 aa  92.8  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  32.9 
 
 
464 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  33.33 
 
 
452 aa  90.5  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  36 
 
 
451 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  31.86 
 
 
453 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  28.63 
 
 
449 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  35.23 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  30.74 
 
 
452 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  28.21 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.49 
 
 
449 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  29.59 
 
 
452 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  33.64 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  28.57 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  30.08 
 
 
528 aa  86.7  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  31.25 
 
 
451 aa  86.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  30.91 
 
 
444 aa  85.9  1e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  27.86 
 
 
444 aa  85.5  1e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2219  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.76 
 
 
414 aa  85.9  1e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437229  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0909  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.16 
 
 
416 aa  85.5  1e-15  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.86309  normal  0.369802 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0762  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.16 
 
 
416 aa  85.1  2e-15  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.644908  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  29.3 
 
 
435 aa  85.1  2e-15  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  29.44 
 
 
430 aa  85.1  2e-15  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.33 
 
 
442 aa  84.3  3e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  30.45 
 
 
444 aa  84.3  3e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  30.26 
 
 
471 aa  84  4e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  27.8 
 
 
443 aa  83.6  6e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  26.79 
 
 
444 aa  82.8  8e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  5.12112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  29.2 
 
 
436 aa  82.4  1e-14  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  29.68 
 
 
442 aa  82.4  1e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  30.37 
 
 
442 aa  82.4  1e-14  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  28.37 
 
 
435 aa  81.6  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  27.63 
 
 
336 aa  81.6  2e-14  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  28.37 
 
 
435 aa  81.6  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02220  nucleolus protein, putative  29.57 
 
 
695 aa  80.9  3e-14  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0735574  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  28.46 
 
 
447 aa  81.3  3e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2001  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.36 
 
 
415 aa  80.5  4e-14  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  28.87 
 
 
410 aa  80.5  4e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  26.29 
 
 
453 aa  80.1  5e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  29.6 
 
 
443 aa  80.1  6e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  29.55 
 
 
444 aa  79.7  7e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  29.55 
 
 
444 aa  79.7  7e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  29.55 
 
 
444 aa  79.7  7e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  29.55 
 
 
444 aa  79.7  7e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  29.55 
 
 
444 aa  79.7  7e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  26.42 
 
 
428 aa  79  1e-13  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3722  sun protein  34.55 
 
 
444 aa  78.6  1e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0576  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.24 
 
 
354 aa  78.2  2e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.391769  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  31.14 
 
 
448 aa  77.4  3e-13  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  25.3 
 
 
455 aa  77.4  4e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  27.47 
 
 
339 aa  77.4  4e-13  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.23 
 
 
419 aa  77  5e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.7 
 
 
424 aa  76.6  6e-13  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  32.33 
 
 
452 aa  76.6  7e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_2054  predicted protein  30.67 
 
 
485 aa  75.9  1e-12  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  31.67 
 
 
448 aa  75.9  1e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  30.74 
 
 
452 aa  75.9  1e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.7 
 
 
438 aa  74.7  2e-12  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98868e-06 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  30.97 
 
 
434 aa  74.7  2e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  31.22 
 
 
420 aa  74.7  2e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  31.22 
 
 
420 aa  74.7  2e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  31.22 
 
 
420 aa  74.7  2e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  31.22 
 
 
420 aa  75.1  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  31.22 
 
 
420 aa  75.1  2e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  31.22 
 
 
420 aa  75.1  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1108  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.09 
 
 
301 aa  74.7  2e-12  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000188231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  31.22 
 
 
420 aa  74.7  2e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  30.69 
 
 
449 aa  74.3  3e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1936  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  30.88 
 
 
481 aa  74.3  3e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00306451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  32.5 
 
 
420 aa  74.3  3e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  34.29 
 
 
450 aa  74.3  3e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  29.95 
 
 
406 aa  74.3  4e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  27.48 
 
 
438 aa  73.9  4e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.64 
 
 
420 aa  73.6  5e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.64 
 
 
420 aa  73.6  5e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  7.17597e-07 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0664  NOL1/NOP2/sun family protein  27.63 
 
 
279 aa  73.6  6e-12  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.61 
 
 
459 aa  73.2  8e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  33.5 
 
 
421 aa  73.2  8e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  32.77 
 
 
450 aa  72.8  9e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  32.78 
 
 
437 aa  72.4  1e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2580  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  29.69 
 
 
454 aa  72.8  1e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.5 
 
 
421 aa  72.4  1e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  28.81 
 
 
438 aa  72  1e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  28.81 
 
 
438 aa  72  1e-11  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0901  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.91 
 
 
455 aa  72  2e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  27.97 
 
 
434 aa  71.2  2e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>