More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3499 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  100 
 
 
288 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  61.32 
 
 
290 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  70.66 
 
 
290 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  58.95 
 
 
290 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  58.68 
 
 
290 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  62.32 
 
 
291 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  60 
 
 
289 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  59.65 
 
 
291 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  64.58 
 
 
295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  64.24 
 
 
295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  64.24 
 
 
295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  60.7 
 
 
288 aa  306  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  58.01 
 
 
290 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  58.68 
 
 
289 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  57.99 
 
 
290 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  56.36 
 
 
299 aa  295  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  56.99 
 
 
294 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  60.3 
 
 
296 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  59.18 
 
 
293 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  57.84 
 
 
290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  56.69 
 
 
290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  56.69 
 
 
289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  56.69 
 
 
289 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  57.34 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  58.33 
 
 
289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  56.94 
 
 
290 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  57.41 
 
 
300 aa  279  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  61.65 
 
 
304 aa  279  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  56.58 
 
 
284 aa  278  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  57.04 
 
 
290 aa  278  9e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  61.75 
 
 
288 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  56.94 
 
 
284 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  56.23 
 
 
286 aa  275  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  62.69 
 
 
288 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  56.54 
 
 
284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  57.84 
 
 
290 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  57.46 
 
 
285 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  49.47 
 
 
290 aa  248  6e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  54.85 
 
 
288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  55.19 
 
 
287 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  48.95 
 
 
284 aa  238  6.999999999999999e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  58.74 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  33.72 
 
 
278 aa  149  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  33.72 
 
 
278 aa  149  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  33.21 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.51 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  32.27 
 
 
289 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.04 
 
 
279 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  28.83 
 
 
288 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  34.3 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  36.58 
 
 
282 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  28.83 
 
 
288 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  28.83 
 
 
288 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  34.29 
 
 
285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  28.47 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  28.72 
 
 
288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  29.56 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  34.9 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.05 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 
278 aa  126  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  33.82 
 
 
285 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  38.85 
 
 
303 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  30.92 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.04 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  35.29 
 
 
441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  30.48 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  30.48 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  30.48 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  34.95 
 
 
441 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  32.96 
 
 
279 aa  119  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  29.79 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  34.43 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  29.79 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  32.2 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  29.43 
 
 
300 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  31.65 
 
 
281 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  31.72 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  35.48 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4437  ABC-3 protein  35.36 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  26.8 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  34.52 
 
 
351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  31.11 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  27.97 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  34.35 
 
 
279 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  32.34 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  33.33 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  31.48 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  30.85 
 
 
291 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  31.85 
 
 
289 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  29.02 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  29.02 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  30.69 
 
 
306 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  30.37 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.86 
 
 
282 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  30.74 
 
 
290 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  31.48 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  34.48 
 
 
304 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  31.02 
 
 
292 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  29.75 
 
 
415 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  31.3 
 
 
282 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>