More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3053 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  100 
 
 		 315 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  74.92 
 
 		 315 aa  471  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  61.74 
 
 		 306 aa  362  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  61.09 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  58.52 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  55.45 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  53.67 
 
 		 311 aa  295  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  52.12 
 
 		 326 aa  292  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  50.65 
 
 		 327 aa  289  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  51.29 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  50.65 
 
 		 349 aa  285  7e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  50.65 
 
 		 316 aa  277  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  48.56 
 
 		 318 aa  275  8e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  50.95 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  52.22 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  52.1 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  48.55 
 
 		 305 aa  261  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  48.25 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  44.69 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  49.68 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  47.42 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  44.79 
 
 		 309 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  45.62 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  44.16 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  41.64 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  43.71 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  43.71 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  43.71 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  45.77 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  42.45 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  40.79 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  39.86 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  42.55 
 
 		 371 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  42.09 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  42.09 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  45.09 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  39.53 
 
 		 386 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  39.13 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  39.13 
 
 		 358 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.78 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 280 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  38.99 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  39.42 
 
 		 359 aa  178  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  38.28 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  39.71 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.86 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  39.49 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  37.28 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  41.09 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  39.49 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  39.49 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  38.08 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  40.94 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  39.13 
 
 		 364 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  44.09 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  38.77 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.41 
 
 		 364 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  38.41 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  38.41 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  38.41 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  38.35 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  41.38 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  34.18 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  41.97 
 
 		 362 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  37.32 
 
 		 382 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  36 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.82 
 
 		 373 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  41.45 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.22 
 
 		 358 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  39.78 
 
 		 360 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.58 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  41.07 
 
 		 282 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  39.36 
 
 		 280 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  35.13 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.24 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  37.99 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  36.96 
 
 		 393 aa  166  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.78 
 
 		 362 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3149  prephenate dehydratase  37.63 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.286294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  36.86 
 
 		 356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  36.63 
 
 		 277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  37.99 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  39.78 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  35.74 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  37.99 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.18 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4179  prephenate dehydratase  37.63 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409752  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  36.59 
 
 		 393 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  38.85 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  37.09 
 
 		 402 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  40.43 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  37.5 
 
 		 366 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.55 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  37.55 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4168  prephenate dehydratase  37.28 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  38.99 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  38.27 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4514  prephenate dehydratase  37.28 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.682816 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  39.93 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  36.27 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>