More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0854 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
174 aa  350  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  70 
 
 
177 aa  250  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  68.24 
 
 
172 aa  248  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  60 
 
 
173 aa  217  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  60 
 
 
173 aa  217  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  60 
 
 
175 aa  214  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  60 
 
 
175 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  58.93 
 
 
172 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  58.48 
 
 
175 aa  210  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  58.96 
 
 
175 aa  206  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  56.32 
 
 
181 aa  205  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  61.54 
 
 
174 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  56.14 
 
 
174 aa  205  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  55.49 
 
 
203 aa  199  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  57.8 
 
 
175 aa  198  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  56.65 
 
 
177 aa  197  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  56 
 
 
176 aa  195  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  54.95 
 
 
182 aa  189  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  54.95 
 
 
182 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  54.95 
 
 
182 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  52.84 
 
 
178 aa  188  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  50.86 
 
 
188 aa  187  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  51.7 
 
 
187 aa  186  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  58.38 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  51.15 
 
 
194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  55.87 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  50.57 
 
 
194 aa  181  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1148  NusG antitermination factor  49.13 
 
 
207 aa  179  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000795097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  56.65 
 
 
177 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  51.15 
 
 
201 aa  174  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  46.86 
 
 
175 aa  173  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  56.07 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  56.07 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  56.07 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  56.07 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  56.07 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  56.07 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  56.07 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  56.07 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  49.43 
 
 
176 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  47.7 
 
 
177 aa  171  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 
177 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  47.57 
 
 
266 aa  170  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  46.96 
 
 
250 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  50.87 
 
 
176 aa  169  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  45 
 
 
266 aa  168  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  48.09 
 
 
273 aa  168  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  45.35 
 
 
180 aa  167  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  46.2 
 
 
306 aa  167  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  48.26 
 
 
175 aa  167  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  48.26 
 
 
175 aa  167  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  50.85 
 
 
181 aa  167  7e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  46.55 
 
 
175 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  45.31 
 
 
272 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  45.4 
 
 
175 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  45.79 
 
 
272 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  49.41 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  46.89 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  43.96 
 
 
243 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  48 
 
 
178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  46.51 
 
 
175 aa  164  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  46.59 
 
 
180 aa  165  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  45.41 
 
 
276 aa  165  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 
185 aa  165  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  45.79 
 
 
238 aa  164  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  50.28 
 
 
228 aa  164  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 
266 aa  165  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 
176 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  46.37 
 
 
202 aa  164  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  51.41 
 
 
178 aa  164  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  44.92 
 
 
267 aa  164  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  44.92 
 
 
280 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  47.31 
 
 
265 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  48.82 
 
 
177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  43.93 
 
 
176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 
176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  41.97 
 
 
317 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  44.56 
 
 
299 aa  164  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  44 
 
 
176 aa  164  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  49.41 
 
 
177 aa  163  9e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  45.86 
 
 
238 aa  163  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  46.7 
 
 
246 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  42.86 
 
 
176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  46.78 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  43.52 
 
 
270 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  43.52 
 
 
271 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  43.52 
 
 
270 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  42.86 
 
 
176 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  44.13 
 
 
180 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  42.86 
 
 
176 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  43.68 
 
 
176 aa  160  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  44.51 
 
 
184 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  41.95 
 
 
176 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  50.28 
 
 
185 aa  159  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  48.62 
 
 
183 aa  159  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  49.43 
 
 
179 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  43.43 
 
 
176 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  45.93 
 
 
175 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  46.55 
 
 
176 aa  159  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  44.07 
 
 
179 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0500837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>