More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2660 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  78.44 
 
 		 427 aa  682    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  77.96 
 
 		 427 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  77.49 
 
 		 426 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  76.36 
 
 		 425 aa  678    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  71.36 
 
 		 431 aa  636    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  76.83 
 
 		 427 aa  692    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  76.36 
 
 		 425 aa  678    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  78.67 
 
 		 427 aa  716    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 425 aa  879    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  71.57 
 
 		 423 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  71.57 
 
 		 423 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  71.32 
 
 		 423 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  70.28 
 
 		 429 aa  625  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  70.83 
 
 		 423 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  69.36 
 
 		 416 aa  617  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  71.04 
 
 		 411 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  71.04 
 
 		 411 aa  614  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  69.98 
 
 		 424 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 415 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 419 aa  537  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 411 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 412 aa  531  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 429 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  60.74 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 		 431 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 437 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 431 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 		 420 aa  526  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 422 aa  526  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  59.14 
 
 		 431 aa  521  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 413 aa  522  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 415 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.08 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 422 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 		 417 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 416 aa  521  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 438 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 438 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 413 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 412 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 		 415 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 439 aa  521  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 413 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 414 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 414 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 414 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  59.33 
 
 		 432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 413 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  58.21 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 413 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 		 508 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 410 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 415 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  58.61 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  61.14 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>