More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2978 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
385 aa  746    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  76.74 
 
 
368 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  76.19 
 
 
366 aa  541  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  68.93 
 
 
386 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  67.02 
 
 
385 aa  474  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  65.69 
 
 
374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  70.43 
 
 
368 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  66.49 
 
 
373 aa  465  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  65.25 
 
 
386 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  65.25 
 
 
386 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  65.25 
 
 
386 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  64.12 
 
 
398 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  63.2 
 
 
373 aa  441  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  66.67 
 
 
380 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  63.64 
 
 
369 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  59.49 
 
 
390 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  61.23 
 
 
397 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  64.63 
 
 
389 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  66.21 
 
 
363 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  57.84 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  60.16 
 
 
372 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  53.78 
 
 
357 aa  341  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  53.96 
 
 
385 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  54.4 
 
 
370 aa  329  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  54.03 
 
 
381 aa  322  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  44.83 
 
 
367 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  51.86 
 
 
372 aa  312  6.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  62.31 
 
 
266 aa  279  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  52.74 
 
 
483 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  43.65 
 
 
356 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  45.54 
 
 
421 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  41.75 
 
 
433 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  42.19 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  46.91 
 
 
402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  42.7 
 
 
375 aa  239  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  43.8 
 
 
369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  44.89 
 
 
360 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  39.89 
 
 
323 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  38.9 
 
 
340 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  39.83 
 
 
329 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  40 
 
 
318 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  39.51 
 
 
376 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  38.23 
 
 
388 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  44.05 
 
 
244 aa  189  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.03 
 
 
248 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  36.34 
 
 
323 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  37.79 
 
 
342 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.09 
 
 
240 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  34.13 
 
 
372 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  36.57 
 
 
323 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  35.95 
 
 
340 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  36.19 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  35.05 
 
 
340 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  36.93 
 
 
345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  37.9 
 
 
338 aa  162  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  28.46 
 
 
379 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  34.76 
 
 
323 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  33.24 
 
 
329 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  36.07 
 
 
331 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.81 
 
 
340 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  30.65 
 
 
386 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  35.05 
 
 
342 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  34.82 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.09 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  36.09 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  31.49 
 
 
398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  34.82 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  37.74 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  37.47 
 
 
343 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  37.47 
 
 
343 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  36.36 
 
 
453 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.81 
 
 
341 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  35.51 
 
 
342 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  35.73 
 
 
356 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  35.8 
 
 
341 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  35.8 
 
 
341 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  35.8 
 
 
341 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  32.97 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  36.74 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  34.08 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  35.23 
 
 
341 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  30.2 
 
 
400 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  49.06 
 
 
225 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  34.35 
 
 
323 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  37.79 
 
 
315 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  35.23 
 
 
341 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  30.29 
 
 
372 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  35.23 
 
 
341 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  34.63 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  34.07 
 
 
323 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  34.72 
 
 
334 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  35.52 
 
 
329 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  31.96 
 
 
389 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  33.24 
 
 
365 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  36.14 
 
 
343 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  32.59 
 
 
326 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  28.9 
 
 
385 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  33.24 
 
 
326 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  32.44 
 
 
364 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  34.29 
 
 
362 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>