237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2192 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  414  1e-115  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  51.56 
 
 
206 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  49.48 
 
 
198 aa  202  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.27558e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  50.78 
 
 
201 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  47.89 
 
 
198 aa  192  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  1.64661e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  47.34 
 
 
198 aa  189  3e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  45.9 
 
 
201 aa  175  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  42.62 
 
 
219 aa  164  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  42.86 
 
 
205 aa  147  1e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  38.5 
 
 
203 aa  146  2e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  38.5 
 
 
203 aa  146  2e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.725e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  38.5 
 
 
203 aa  146  2e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  37.04 
 
 
207 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  39.27 
 
 
204 aa  141  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  38.29 
 
 
204 aa  140  1e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  39.18 
 
 
205 aa  140  1e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  38.82 
 
 
209 aa  140  2e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  40.34 
 
 
211 aa  137  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  38.5 
 
 
204 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  37.44 
 
 
204 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  38.17 
 
 
290 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  37.37 
 
 
204 aa  135  3e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  135  3e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  37.31 
 
 
204 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  38.64 
 
 
204 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  42.78 
 
 
194 aa  134  7e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  36.9 
 
 
204 aa  134  7e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  36.32 
 
 
204 aa  134  7e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  36.84 
 
 
204 aa  134  1e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  2.52745e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  37.43 
 
 
204 aa  134  1e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  38.42 
 
 
204 aa  132  4e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  41.01 
 
 
194 aa  131  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  36.9 
 
 
204 aa  130  1e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.19511e-05  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  40.35 
 
 
176 aa  130  2e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  40.45 
 
 
194 aa  129  2e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  36.87 
 
 
206 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  39.2 
 
 
239 aa  128  5e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  34.59 
 
 
242 aa  128  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  37.04 
 
 
207 aa  128  7e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  36.9 
 
 
207 aa  127  1e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  37.37 
 
 
204 aa  127  1e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69816e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  39.77 
 
 
204 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  36.36 
 
 
204 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  34.59 
 
 
211 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.86376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  35.83 
 
 
204 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  38.07 
 
 
204 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  39.89 
 
 
195 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  37.5 
 
 
197 aa  122  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  39.89 
 
 
195 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  37.37 
 
 
206 aa  122  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  40.34 
 
 
195 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  41.67 
 
 
245 aa  121  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  36.11 
 
 
203 aa  121  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  36.63 
 
 
274 aa  121  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  37.5 
 
 
222 aa  121  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  41.06 
 
 
213 aa  120  1e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  34.21 
 
 
213 aa  120  1e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  38.76 
 
 
195 aa  120  2e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  38.76 
 
 
195 aa  120  2e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 
207 aa  120  2e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.70968e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  38.76 
 
 
195 aa  120  2e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  39.16 
 
 
195 aa  119  4e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  35.58 
 
 
203 aa  118  5e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  37.5 
 
 
196 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  34.48 
 
 
203 aa  118  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  37.5 
 
 
196 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  36.78 
 
 
232 aa  118  7e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  37.5 
 
 
303 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  37.5 
 
 
303 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  36.84 
 
 
202 aa  118  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  36.26 
 
 
209 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  34.22 
 
 
211 aa  117  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  34.22 
 
 
211 aa  117  1e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.22 
 
 
211 aa  117  1e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.48336e-11 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  34.22 
 
 
211 aa  117  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.69 
 
 
211 aa  117  1e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  37.5 
 
 
303 aa  116  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  34.22 
 
 
211 aa  116  2e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  37.97 
 
 
204 aa  116  2e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  42.58 
 
 
208 aa  116  2e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  34.22 
 
 
211 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  34.72 
 
 
211 aa  115  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  38.01 
 
 
214 aa  115  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  38.15 
 
 
213 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  34.22 
 
 
211 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.22 
 
 
211 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  33.69 
 
 
212 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  35.79 
 
 
211 aa  115  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  37.64 
 
 
213 aa  114  7e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  35.6 
 
 
200 aa  114  8e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  33.16 
 
 
211 aa  114  8e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  2.66179e-13 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  36.56 
 
 
218 aa  114  1e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  36.9 
 
 
204 aa  113  2e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  37.43 
 
 
205 aa  113  2e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.8448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  36.9 
 
 
204 aa  113  2e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  37.43 
 
 
205 aa  113  2e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  36.9 
 
 
204 aa  113  2e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  38.17 
 
 
212 aa  112  2e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  37.43 
 
 
205 aa  113  2e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>