More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1392 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  100 
 
 		 245 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  69.04 
 
 		 252 aa  279  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  56.96 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  55.83 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  54.85 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  50.41 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  55.37 
 
 		 252 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  52.25 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  51.05 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  49.8 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  48.77 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  50 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25080  methyltransferase family protein  46.41 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.779034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  48.95 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  43.21 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  42.25 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  30.67 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.25 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  30.25 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  30.25 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  30.25 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  30.25 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  30.25 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  30.25 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  30.66 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  31.38 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  31.38 
 
 		 267 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  31.38 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  31.38 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  31.38 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  30.36 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  28.03 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  30.8 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  28.27 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  25.77 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  25.69 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  26.67 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  27.39 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  30.13 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  25 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  24.7 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  30.66 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  27.2 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  27.2 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  28.99 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  25 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  27.2 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  28.74 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  29.77 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  26 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  29.41 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  26.25 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  24.21 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  26.46 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  30.17 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  30.14 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  29.2 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  31.39 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  26.98 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  23.29 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  33.88 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  26.15 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.29 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  45.38 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.82 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.93 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1519  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.71 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  29.47 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  27.48 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.14 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  28.99 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.68 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 457 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  37.62 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.9 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  34.92 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  32.09 
 
 		 335 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.54 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>