More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0857 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  75.54 
 
 		 185 aa  291  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  75.81 
 
 		 185 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  72.83 
 
 		 185 aa  284  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2891  elongation factor P  73.66 
 
 		 185 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.665386  normal  0.0670504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  72.83 
 
 		 185 aa  280  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1093  elongation factor P  73.12 
 
 		 185 aa  279  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  73.8 
 
 		 186 aa  278  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0565  translation elongation factor P  68.62 
 
 		 189 aa  278  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  71.12 
 
 		 188 aa  276  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  72.04 
 
 		 185 aa  274  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  69.02 
 
 		 184 aa  273  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  72.73 
 
 		 186 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  71.51 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  71.51 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  71.51 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  71.51 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  71.51 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  71.51 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  71.51 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  66.3 
 
 		 184 aa  271  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  70.11 
 
 		 184 aa  270  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  70.05 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  70.59 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1017  elongation factor P  70.43 
 
 		 185 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1021  elongation factor P  70.43 
 
 		 185 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  65.22 
 
 		 199 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2163  elongation factor P  69.89 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  69.35 
 
 		 185 aa  268  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  67.39 
 
 		 184 aa  267  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  68.48 
 
 		 184 aa  267  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  68.82 
 
 		 185 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  68.82 
 
 		 185 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  66.85 
 
 		 184 aa  265  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  68.82 
 
 		 185 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  66.85 
 
 		 184 aa  265  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  66.85 
 
 		 184 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  65.76 
 
 		 184 aa  262  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  66.31 
 
 		 188 aa  259  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2242  elongation factor P  64.13 
 
 		 184 aa  256  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2304  elongation factor P  67.2 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0302862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27210  elongation factor P  67.2 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.791467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1699  elongation factor P  63.83 
 
 		 188 aa  250  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000109401  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  64.17 
 
 		 186 aa  249  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120633  unclonable  0.00000167912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  62.9 
 
 		 186 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  62.03 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000014351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  62.37 
 
 		 186 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  60.96 
 
 		 186 aa  239  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  0.0000774708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  61.29 
 
 		 186 aa  238  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2038  elongation factor P  63.44 
 
 		 186 aa  227  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000835391  hitchhiker  0.00115399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1937  elongation factor P  63.44 
 
 		 186 aa  227  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000886645  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2141  elongation factor P  63.44 
 
 		 186 aa  227  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.000269097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0999  elongation factor P  63.83 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.692451  normal  0.398098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1875  elongation factor P  62.37 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000405635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2328  elongation factor P  62.9 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0934  elongation factor P  63.83 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  0.0465306 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2245  elongation factor P  61.83 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000454991  decreased coverage  0.0000000000324957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2189  elongation factor P  61.83 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000173  unclonable  0.00000474923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2139  elongation factor P  61.83 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4518  elongation factor P  61.83 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2232  elongation factor P  61.83 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1898  Elongation factor P  56.68 
 
 		 189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2130  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  54.26 
 
 		 190 aa  207  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0576423  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  55.56 
 
 		 189 aa  205  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  55.03 
 
 		 189 aa  201  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  54.26 
 
 		 189 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  54.26 
 
 		 189 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  53.97 
 
 		 189 aa  198  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  53.72 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  53.72 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0996  translation elongation factor P  42.93 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  41.36 
 
 		 191 aa  141  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  38.38 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  41.21 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  37.84 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  37.84 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  34.95 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  36.22 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  35.83 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  36.22 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  36.22 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  35.68 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  39.46 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  39.16 
 
 		 186 aa  121  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  36.11 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  34.76 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  36.81 
 
 		 189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  36.61 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  34.97 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0720  elongation factor P  33.33 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2021  translation elongation factor P  34.78 
 
 		 187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  34.62 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  35.14 
 
 		 185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  32.42 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  39.41 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  33.87 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  37.1 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  34.78 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  31.55 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>