More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0720 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0720  elongation factor P  100 
 
 		 185 aa  376  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1695  elongation factor P  75.27 
 
 		 186 aa  293  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1715  elongation factor P  75.81 
 
 		 186 aa  276  1e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000224452  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  52.43 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  51.11 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1673  elongation factor P  51.35 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0528858 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  48.62 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  47.03 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  45.95 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  45.95 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  44.86 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  45.41 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  46.49 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  44.86 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  44.86 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  44.86 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  44.86 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  44.86 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4726  translation elongation factor P  41.85 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0198786  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0011  elongation factor P  43.24 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000591354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  46.2 
 
 		 186 aa  154  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  39.67 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  43.48 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  39.13 
 
 		 188 aa  150  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0845  elongation factor P  42.16 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  42.16 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  41.44 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  40.76 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0094  elongation factor P  41.62 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  41.62 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  41.08 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  42.39 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  42.31 
 
 		 190 aa  147  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  39.44 
 
 		 190 aa  147  8e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  42.46 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  40.76 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  41.85 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  38.59 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  38.59 
 
 		 186 aa  144  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  42.47 
 
 		 187 aa  144  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  41.3 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  38.92 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  40.32 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  40.78 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  42.16 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  43.24 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  39.04 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  40.54 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  38.59 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  38.59 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  40.22 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  37.5 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  40.22 
 
 		 187 aa  138  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  39.13 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  38.04 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  38.04 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  37.84 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0733  translation elongation factor P  35.83 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  35.75 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  37.5 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  39.13 
 
 		 186 aa  134  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  36.41 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  41.34 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  38.04 
 
 		 185 aa  134  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41511  predicted protein  37.22 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0285567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  38.92 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  39.46 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3072  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  37.5 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  36.41 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  40.22 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  38.59 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  38.33 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  40.49 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  38.92 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  40.22 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  38.92 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  39.26 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  39.26 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  39.26 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  36.22 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  39.46 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  35.87 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  39.78 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>