More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0247 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  100 
 
 		 364 aa  699    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  37.35 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  37.95 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  37.85 
 
 		 364 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  36.81 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  37.77 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  41.32 
 
 		 382 aa  212  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  38.32 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  34.04 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  34.04 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  38.55 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  40.42 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  42.11 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  40.73 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  37.21 
 
 		 344 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  39.76 
 
 		 373 aa  206  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  39.17 
 
 		 378 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  39.86 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  36.27 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  35.62 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  42.11 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  37.43 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  36.02 
 
 		 372 aa  203  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  39.88 
 
 		 374 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  36.02 
 
 		 396 aa  202  7e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  39.5 
 
 		 388 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  39.88 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  38.67 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  37.23 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  37.67 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  37.36 
 
 		 383 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  38.42 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  38.15 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  31.79 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  37.78 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  37.63 
 
 		 378 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  37.37 
 
 		 383 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  37.83 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  37.53 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  42.14 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  40.12 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  44.67 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  38.58 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  36.52 
 
 		 377 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  39.88 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  45.15 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  37.46 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  45.05 
 
 		 377 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  35.06 
 
 		 383 aa  192  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  37.07 
 
 		 382 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  31.14 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  36.44 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  44.69 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  36.57 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  36.62 
 
 		 379 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  37.83 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  44.69 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  31.89 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  37.54 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  36.49 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  35.79 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  36.01 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  36.9 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  43.22 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  35.64 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  31.62 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  37.35 
 
 		 367 aa  186  6e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  31.81 
 
 		 369 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  38.79 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  36.56 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  40.96 
 
 		 447 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  39.34 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  35.08 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  40.96 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  39.93 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  34.42 
 
 		 373 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  41.15 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  40.36 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  36.62 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  35.61 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  40.56 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  36.49 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  34.55 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0101  hypothetical protein  36.96 
 
 		 357 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  37.09 
 
 		 376 aa  179  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  34.6 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  33.07 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  34.05 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4225  ABC transporter inner membrane protein  41.9 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.220227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0174  ABC transporter, permease protein, putative  35.04 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0373  ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  41.77 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  32.27 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0491  protein of unknown function DUF140  40.32 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13825  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1361  ABC transporter, permease protein  40.86 
 
 		 428 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  33.62 
 
 		 391 aa  169  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0431  putative ABC transporter, permease protein  36.42 
 
 		 374 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.238842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0612  ABC transporter, permease protein  36.42 
 
 		 374 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>