More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0206 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  100 
 
 
150 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  68.5 
 
 
145 aa  187  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  66.94 
 
 
127 aa  186  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  67.97 
 
 
149 aa  180  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  62.22 
 
 
143 aa  180  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  63.64 
 
 
123 aa  174  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  62.9 
 
 
125 aa  173  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  63.11 
 
 
129 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  57.93 
 
 
144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  56.46 
 
 
144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.48 
 
 
142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  59.2 
 
 
129 aa  168  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  59.5 
 
 
129 aa  167  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  59.68 
 
 
138 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  62.5 
 
 
143 aa  165  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65.52 
 
 
124 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.5 
 
 
137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.68 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  62.12 
 
 
153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.98 
 
 
146 aa  157  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  57.6 
 
 
173 aa  153  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.55 
 
 
131 aa  152  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.92 
 
 
153 aa  150  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.47 
 
 
137 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  63.2 
 
 
147 aa  148  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  60.33 
 
 
125 aa  147  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  57.48 
 
 
130 aa  147  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.1 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.24 
 
 
286 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  59.02 
 
 
139 aa  144  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  58.73 
 
 
127 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  58.73 
 
 
127 aa  144  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.7 
 
 
283 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  53.24 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.24 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.39 
 
 
284 aa  144  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.55 
 
 
135 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.39 
 
 
284 aa  144  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  59.69 
 
 
129 aa  144  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  59.52 
 
 
127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  55.17 
 
 
122 aa  142  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  54.96 
 
 
153 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  52.59 
 
 
138 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  53.97 
 
 
137 aa  141  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  54.76 
 
 
135 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.55 
 
 
207 aa  141  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  57.94 
 
 
127 aa  141  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  54.2 
 
 
153 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  54.2 
 
 
153 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1443  scaffold protein  54.33 
 
 
148 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0899521  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  54.33 
 
 
126 aa  141  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  54.26 
 
 
128 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.26 
 
 
128 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  54.26 
 
 
128 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  54.26 
 
 
128 aa  141  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  54.26 
 
 
128 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  54.26 
 
 
128 aa  141  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  54.26 
 
 
128 aa  141  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  54.2 
 
 
153 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  54.76 
 
 
137 aa  140  4e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  53.39 
 
 
211 aa  141  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  52.27 
 
 
138 aa  140  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  54.26 
 
 
128 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  57.14 
 
 
127 aa  141  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.2 
 
 
309 aa  140  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  53.97 
 
 
135 aa  140  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.76 
 
 
128 aa  140  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.67 
 
 
135 aa  140  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  57.14 
 
 
127 aa  140  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.8 
 
 
291 aa  140  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  52.8 
 
 
291 aa  140  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  57.14 
 
 
127 aa  140  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  57.14 
 
 
127 aa  140  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  57.14 
 
 
127 aa  140  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  56.35 
 
 
127 aa  139  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  53.97 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  53.49 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  53.49 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  53.49 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  51.94 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  52.38 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  54.33 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  53.49 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  53.49 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  52.38 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  53.39 
 
 
211 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  56.35 
 
 
127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>