More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0255 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  92.35 
 
 
623 aa  667    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  100 
 
 
750 aa  1485    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  46.3 
 
 
770 aa  595  1e-168  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  45.72 
 
 
705 aa  579  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  43.43 
 
 
702 aa  233  9e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  47.64 
 
 
441 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.08 
 
 
508 aa  195  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  41.34 
 
 
463 aa  191  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  51.61 
 
 
442 aa  189  1e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  50 
 
 
851 aa  183  9.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  51.08 
 
 
819 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  50.53 
 
 
718 aa  180  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  45 
 
 
845 aa  179  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  51.08 
 
 
814 aa  179  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  51.08 
 
 
911 aa  178  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  50.54 
 
 
814 aa  177  8e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  50 
 
 
838 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  42.35 
 
 
875 aa  174  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  45.45 
 
 
519 aa  173  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.11 
 
 
454 aa  173  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  48.35 
 
 
398 aa  173  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.61 
 
 
636 aa  172  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  46.28 
 
 
475 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  41.53 
 
 
394 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  42.52 
 
 
440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.76 
 
 
488 aa  165  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  45.16 
 
 
417 aa  165  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.99 
 
 
462 aa  163  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  60.56 
 
 
426 aa  161  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  43.72 
 
 
408 aa  161  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  52.41 
 
 
390 aa  160  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  37.29 
 
 
399 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.62 
 
 
397 aa  153  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  38.61 
 
 
413 aa  148  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  36.88 
 
 
413 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  37.67 
 
 
413 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  37.67 
 
 
413 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  37.67 
 
 
413 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.83 
 
 
415 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  37.67 
 
 
413 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  37.67 
 
 
413 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  37.67 
 
 
413 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  37.67 
 
 
413 aa  148  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  36.88 
 
 
413 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  36.88 
 
 
413 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  37.42 
 
 
413 aa  147  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  37.21 
 
 
413 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  36.54 
 
 
413 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  53.33 
 
 
265 aa  144  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  36.64 
 
 
405 aa  144  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  47.06 
 
 
264 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  35.5 
 
 
414 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.86 
 
 
428 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.86 
 
 
428 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0779  hypothetical protein  55.71 
 
 
275 aa  140  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000475542  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  37.08 
 
 
408 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  34.53 
 
 
414 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  34.53 
 
 
414 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  34.53 
 
 
414 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  36.74 
 
 
407 aa  138  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  36.3 
 
 
442 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  34.07 
 
 
433 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  34.08 
 
 
410 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  39.77 
 
 
409 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  34.59 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  52.34 
 
 
282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  51.01 
 
 
479 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  51.47 
 
 
856 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.67 
 
 
276 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  37.21 
 
 
414 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  35.32 
 
 
410 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  33.23 
 
 
496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  35.96 
 
 
404 aa  132  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  39.65 
 
 
419 aa  132  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1399  fagellar hook-basal body protein  48.2 
 
 
335 aa  130  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  33.58 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.75 
 
 
431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  47.55 
 
 
266 aa  127  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  38.67 
 
 
419 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  35.16 
 
 
405 aa  127  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  34.59 
 
 
401 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  32.44 
 
 
383 aa  126  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  35.93 
 
 
428 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  35.74 
 
 
405 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  33.97 
 
 
402 aa  125  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  33.97 
 
 
402 aa  125  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  33.77 
 
 
387 aa  124  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  34.8 
 
 
402 aa  124  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  36.36 
 
 
417 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  34.8 
 
 
402 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  35.41 
 
 
404 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  34.8 
 
 
402 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  34.8 
 
 
402 aa  123  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  34.94 
 
 
401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  34.94 
 
 
401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  35.34 
 
 
405 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.75 
 
 
435 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1757  hypothetical protein  48.59 
 
 
310 aa  122  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  46.98 
 
 
260 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  34.94 
 
 
401 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>