More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0213 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  96.18 
 
 
863 aa  1689    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  47.11 
 
 
859 aa  764    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  43.7 
 
 
885 aa  681    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  49.77 
 
 
883 aa  851    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  100 
 
 
863 aa  1743    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  37.3 
 
 
907 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  37.97 
 
 
890 aa  553  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  37.67 
 
 
880 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  35.89 
 
 
875 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  35.59 
 
 
880 aa  528  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  36.45 
 
 
875 aa  525  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  37.27 
 
 
880 aa  521  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  36.1 
 
 
875 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  35.98 
 
 
877 aa  519  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.88 
 
 
877 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  40.86 
 
 
873 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  35.24 
 
 
881 aa  511  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  35.33 
 
 
896 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  35.46 
 
 
904 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  34.89 
 
 
888 aa  500  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  34.29 
 
 
902 aa  501  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  35.31 
 
 
888 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  35.15 
 
 
880 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  35.01 
 
 
898 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  37.8 
 
 
845 aa  483  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.75 
 
 
892 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
873 aa  479  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  34.33 
 
 
867 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.94 
 
 
905 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  36.18 
 
 
769 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  33.9 
 
 
865 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  31.56 
 
 
904 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  30.86 
 
 
909 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.8 
 
 
903 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  33.25 
 
 
907 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  29.44 
 
 
909 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.79 
 
 
903 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  33.66 
 
 
872 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.51 
 
 
903 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
874 aa  365  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.26 
 
 
854 aa  312  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.23 
 
 
847 aa  301  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  31.24 
 
 
1077 aa  279  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.08 
 
 
821 aa  249  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
432 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1450  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.09 
 
 
450 aa  198  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1774  polyA polymerase family protein  34.09 
 
 
450 aa  198  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  32.77 
 
 
388 aa  188  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  47.72 
 
 
383 aa  183  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0642  polynucleotide adenylyltransferase region  41.74 
 
 
374 aa  182  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000899541  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  40.96 
 
 
404 aa  177  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1937  polynucleotide adenylyltransferase  31.79 
 
 
567 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  31.01 
 
 
416 aa  162  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  31.55 
 
 
418 aa  160  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.12 
 
 
422 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  30.56 
 
 
418 aa  158  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
470 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.69 
 
 
468 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  33.33 
 
 
477 aa  135  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.48 
 
 
469 aa  130  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 
484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  32.73 
 
 
479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.58 
 
 
471 aa  129  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 
475 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 
471 aa  127  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 
483 aa  125  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  33.08 
 
 
474 aa  125  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 
489 aa  122  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 
479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 
495 aa  118  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  32.02 
 
 
483 aa  118  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03271  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.08 
 
 
415 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  29.35 
 
 
476 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03261  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.08 
 
 
415 aa  117  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0305  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.08 
 
 
415 aa  117  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3525  Polynucleotide adenylyltransferase region  45.55 
 
 
448 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
561 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0184  polyA polymerase  33.2 
 
 
403 aa  116  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.0507556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  31.82 
 
 
450 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.38 
 
 
415 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03821  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  37.64 
 
 
418 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.150415  normal  0.362341 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1668  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  37.64 
 
 
418 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.25 
 
 
403 aa  110  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  31.36 
 
 
475 aa  108  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2667  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  36 
 
 
410 aa  107  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0551  polynucleotide adenylyltransferase region  35.81 
 
 
377 aa  107  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  32.52 
 
 
471 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
552 aa  105  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2798  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  35.11 
 
 
410 aa  104  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  30.4 
 
 
483 aa  103  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3468  metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 
424 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892703  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31221  predicted protein  33.62 
 
 
559 aa  102  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.443393 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.44 
 
 
462 aa  101  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0065  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 
467 aa  101  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000449224  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  32.39 
 
 
485 aa  101  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 
484 aa  100  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  31.28 
 
 
489 aa  99.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  28.46 
 
 
399 aa  99.4  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  31.09 
 
 
475 aa  99.4  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 
499 aa  98.6  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>