More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0190 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  57.32 
 
 		 174 aa  175  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  53.01 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  51.83 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  48.17 
 
 		 160 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3598  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313573  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3283  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.780852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  44.91 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  45.12 
 
 		 158 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  45.12 
 
 		 158 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  45.51 
 
 		 159 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  45.78 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  41.1 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  46.39 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  45 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  43.98 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  50.4 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  42.5 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  42.35 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  48.8 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  47.33 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  41.38 
 
 		 167 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  38.46 
 
 		 159 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  38.46 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  47.69 
 
 		 185 aa  101  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  46.09 
 
 		 147 aa  101  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  39.39 
 
 		 162 aa  101  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  47.69 
 
 		 176 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  39.05 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  37.65 
 
 		 160 aa  99.4  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  45.45 
 
 		 159 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  42.75 
 
 		 168 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  42.96 
 
 		 168 aa  98.2  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  41.67 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  38.92 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  44.85 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  42.5 
 
 		 169 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  37.87 
 
 		 161 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  41.73 
 
 		 158 aa  96.3  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  41.79 
 
 		 157 aa  95.9  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  36.26 
 
 		 167 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  38.29 
 
 		 168 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  45.04 
 
 		 200 aa  95.9  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  41.26 
 
 		 165 aa  95.5  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.26 
 
 		 158 aa  95.5  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  42.4 
 
 		 157 aa  95.5  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  38.37 
 
 		 157 aa  94.4  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  42.75 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  42.75 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  42.75 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  42.75 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  36.43 
 
 		 152 aa  93.2  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  36.43 
 
 		 152 aa  93.2  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  37.76 
 
 		 152 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  37.69 
 
 		 155 aa  92.8  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  41.84 
 
 		 167 aa  92.8  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  41.98 
 
 		 157 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  36.14 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  39.85 
 
 		 154 aa  91.3  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  42.31 
 
 		 154 aa  91.3  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  43.08 
 
 		 154 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1155  hypothetical protein  31.94 
 
 		 154 aa  89.4  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.8201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  40 
 
 		 158 aa  89  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  37.76 
 
 		 158 aa  89  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  37.76 
 
 		 158 aa  89  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  42.31 
 
 		 154 aa  89  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  39.86 
 
 		 154 aa  89  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  37.21 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0927  hypothetical protein  32.41 
 
 		 154 aa  88.6  5e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  37.91 
 
 		 158 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  36.36 
 
 		 149 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  40.6 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  45.97 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  37.87 
 
 		 155 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  41.09 
 
 		 160 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  37.87 
 
 		 155 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  37.87 
 
 		 155 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  37.87 
 
 		 155 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  37.87 
 
 		 155 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  37.87 
 
 		 155 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1832  putative metalloprotease  38.37 
 
 		 157 aa  85.1  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  37.87 
 
 		 155 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  37.87 
 
 		 155 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  84.7  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  37.28 
 
 		 155 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0626  hypothetical protein  38.78 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0872327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  35 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  34.42 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  35 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  33.79 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  40 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  37.6 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  44.14 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3007  putative metalloprotease  38.37 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997862  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0590  hypothetical protein  37.76 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  38.4 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  37.98 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  36.09 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  37.6 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>