More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1589 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  100 
 
 		 168 aa  331  3e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  42.38 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  39.74 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  35.12 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  34.52 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  34.52 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  34.52 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  34.52 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  35.12 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  39.33 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  35.4 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  33.93 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.12 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.93 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.12 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  36.05 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  33.93 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  33.93 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  33.93 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  37.04 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  35.12 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  34.73 
 
 		 176 aa  110  6e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  38.06 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  37.31 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  37.31 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  34.67 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  35.48 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  36.67 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  32.56 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.74 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  36.6 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  36.6 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  35.62 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  32.93 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  38 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  33.99 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  33.99 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  35.62 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  34.23 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  33.93 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.36 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  36.84 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  34.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  34.93 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  33.33 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  33.77 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  36.13 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  35.57 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  36.71 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  35.76 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  36.11 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  39.84 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  38.85 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  34.19 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  32.48 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  31.01 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  39.13 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.76 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  34.97 
 
 		 160 aa  98.6  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  30.82 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.17 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  37.24 
 
 		 159 aa  98.6  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  28.85 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  31.18 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  35.33 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  34 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.13 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  30.82 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  30.06 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  30 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  30 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  30 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  30.59 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  30.54 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  31.97 
 
 		 154 aa  97.1  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  34.78 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  30.54 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  30.54 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  34.19 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  30.54 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  30.54 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  36.55 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  31.76 
 
 		 163 aa  95.9  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0388  CheW protein  34.03 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  30.63 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  35.34 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  31.54 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  33.33 
 
 		 146 aa  94.4  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.21 
 
 		 157 aa  94.4  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  32.7 
 
 		 174 aa  94  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  32.89 
 
 		 162 aa  94  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  29.34 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  33.56 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  31.54 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  36.03 
 
 		 141 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  31.54 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>