More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0336 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  732    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  33.42 
 
 		 378 aa  156  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  26.32 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  24.25 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  26.16 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  26.69 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  25.91 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  26.51 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  28.49 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  27.48 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  26.51 
 
 		 354 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  33.89 
 
 		 355 aa  123  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  24.72 
 
 		 354 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  25.99 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  24.66 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  25.51 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  23.19 
 
 		 394 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  26.17 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  24.93 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  24.08 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25.54 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  25.16 
 
 		 346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  25.86 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  25.27 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  23.64 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  25.8 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  25.27 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  23.82 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  25.2 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  25.57 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  24.44 
 
 		 371 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  22.4 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  25.78 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  25.29 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  23.26 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  24.42 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  24.72 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  22.85 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  23.69 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  23.74 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  22.85 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  22.85 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  22.85 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  22.85 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  22.85 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  22.85 
 
 		 374 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  23.65 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  26.17 
 
 		 373 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  24 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  23.32 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  24.57 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  21.39 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  22.85 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  25.79 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  21.39 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  21.39 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  21.39 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  22.1 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  23.22 
 
 		 352 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  21.92 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  24.26 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  23.22 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  22.29 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  24.12 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  25.24 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  26.64 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0747  hypothetical protein  25.86 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122791  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  25.57 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  26.51 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  26.51 
 
 		 381 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4645  hypothetical protein  24.06 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  23.44 
 
 		 361 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  26.23 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1365  hypothetical protein  31.14 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1555  hypothetical protein  31.14 
 
 		 347 aa  96.7  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0798  protein of unknown function UPF0118  25.61 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0286  hypothetical protein  29.39 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  24.93 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  29.09 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1276  acid membrane antigen A  29.55 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  28.12 
 
 		 352 aa  89.7  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  25 
 
 		 399 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  24.29 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  23.38 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  27.42 
 
 		 423 aa  86.3  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  25.37 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  24.33 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0383  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.810793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  21.45 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  29.7 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  23.81 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  23.27 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  24.74 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  25.28 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  22.67 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  22.8 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  20.06 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  25.92 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>