More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0044 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0044  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
490 aa  1004    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3162  ABC transporter related protein  53.29 
 
 
488 aa  511  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0458111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2220  ABC transporter related  51.02 
 
 
492 aa  509  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1612  ABC transporter related  51.43 
 
 
495 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.052092  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2313  ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 
492 aa  502  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000196397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2271  ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
492 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2546  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
492 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55199e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2355  ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 
492 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0376605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2531  ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 
492 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1690  ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 
492 aa  485  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359726  hitchhiker  0.0000000000000525976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3229  ABC transporter related  49.29 
 
 
495 aa  485  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736702  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2109  ABC transporter related  47.76 
 
 
492 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0497  ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 
523 aa  456  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.208057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3631  ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 
460 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0818  ABC transporter ATPase  40.69 
 
 
501 aa  385  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000307399  normal  0.444871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  40.85 
 
 
516 aa  378  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2020  ABC transporter related  34.61 
 
 
522 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  28.97 
 
 
577 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.09 
 
 
558 aa  173  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  27.12 
 
 
528 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.05 
 
 
559 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.16 
 
 
559 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  26.48 
 
 
530 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.7 
 
 
670 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  26.84 
 
 
532 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  26.94 
 
 
529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  25.19 
 
 
637 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  25.19 
 
 
637 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.19 
 
 
637 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.19 
 
 
637 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  25.19 
 
 
637 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.19 
 
 
637 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.19 
 
 
637 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.19 
 
 
637 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.19 
 
 
637 aa  163  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.26 
 
 
558 aa  163  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  27.57 
 
 
542 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  27.91 
 
 
548 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  26.24 
 
 
532 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  27.73 
 
 
542 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  27.56 
 
 
542 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  27.2 
 
 
532 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  26.27 
 
 
604 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  27.77 
 
 
548 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.1 
 
 
559 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.19 
 
 
637 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  24.81 
 
 
548 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  26.49 
 
 
529 aa  159  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  24.63 
 
 
528 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.05 
 
 
559 aa  159  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0904  ABC transporter related  25.84 
 
 
527 aa  159  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467195  decreased coverage  0.00659199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  24.22 
 
 
546 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.14 
 
 
542 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2270  ABC transporter related protein  29.22 
 
 
540 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.196548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.42 
 
 
634 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.51 
 
 
635 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.14 
 
 
548 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  26.11 
 
 
623 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.51 
 
 
635 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.9 
 
 
635 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  25.96 
 
 
623 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.51 
 
 
635 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  24.86 
 
 
530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  25.19 
 
 
636 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.51 
 
 
635 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  24.86 
 
 
530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.58 
 
 
634 aa  157  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4180  ABC transporter related  25.93 
 
 
534 aa  157  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0101186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.43 
 
 
558 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  28.25 
 
 
543 aa  156  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  24.62 
 
 
548 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  26 
 
 
639 aa  156  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  24.12 
 
 
636 aa  156  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 
651 aa  156  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  24.58 
 
 
540 aa  156  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  25.49 
 
 
621 aa  156  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.51 
 
 
531 aa  156  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.33 
 
 
560 aa  156  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  25.75 
 
 
645 aa  155  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  26.43 
 
 
537 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  27.29 
 
 
641 aa  156  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  23.7 
 
 
528 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  25.83 
 
 
603 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  24.95 
 
 
636 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  23.99 
 
 
530 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  25.2 
 
 
621 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.64 
 
 
561 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.64 
 
 
561 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1548  ABC transporter related  34.54 
 
 
305 aa  155  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  24.43 
 
 
548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.67 
 
 
555 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  25 
 
 
621 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  27.1 
 
 
542 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  24.02 
 
 
529 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  25.52 
 
 
630 aa  154  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.54 
 
 
555 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  25.52 
 
 
620 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.71 
 
 
563 aa  154  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  25.88 
 
 
637 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  25.14 
 
 
636 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>