55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0017 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  871    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  23.35 
 
 
768 aa  72  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  37.23 
 
 
180 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  29.56 
 
 
757 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  21.22 
 
 
769 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  21.1 
 
 
769 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  28.9 
 
 
449 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  23.03 
 
 
770 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  24.71 
 
 
530 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  27.01 
 
 
534 aa  60.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  23.9 
 
 
566 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  21.41 
 
 
770 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  23.55 
 
 
769 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  28.57 
 
 
755 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  28.08 
 
 
755 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  23.9 
 
 
566 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  22.97 
 
 
332 aa  56.6  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  22.64 
 
 
454 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  23.41 
 
 
566 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  32.59 
 
 
178 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  22.04 
 
 
770 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  32.59 
 
 
178 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  27.05 
 
 
300 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  24.5 
 
 
566 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  35.63 
 
 
181 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  27.5 
 
 
838 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  27.5 
 
 
838 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  27.87 
 
 
291 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  22.37 
 
 
770 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  28 
 
 
836 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  28.08 
 
 
759 aa  50.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  28 
 
 
838 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  29.24 
 
 
240 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  22.84 
 
 
691 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  23.68 
 
 
770 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  23.13 
 
 
770 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  24.64 
 
 
327 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  23.84 
 
 
580 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  31.11 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0473  hypothetical protein  33.64 
 
 
308 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  23.31 
 
 
772 aa  47  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  23.75 
 
 
720 aa  47  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5579  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  23.77 
 
 
722 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  23.75 
 
 
720 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  23.75 
 
 
720 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  23.77 
 
 
722 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  24.46 
 
 
722 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  24.46 
 
 
722 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  42 
 
 
188 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  24.07 
 
 
274 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  23.06 
 
 
577 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  23.03 
 
 
197 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2734  putative lipoprotein  24.68 
 
 
278 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000371316  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  26.32 
 
 
226 aa  43.9  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>