More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1114 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1114  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  324  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  91.25 
 
 
160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  80 
 
 
168 aa  271  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0327  hypothetical protein  78.12 
 
 
160 aa  266  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217088  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10001  hypothetical protein  78.12 
 
 
160 aa  266  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537095  normal  0.391839 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09781  hypothetical protein  74.07 
 
 
162 aa  251  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09761  hypothetical protein  74.07 
 
 
162 aa  251  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  73.12 
 
 
160 aa  250  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0917  hypothetical protein  73.46 
 
 
162 aa  249  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00504908  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  71.6 
 
 
162 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  59.75 
 
 
160 aa  200  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.86 
 
 
160 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.86 
 
 
160 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  56.33 
 
 
159 aa  191  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.09 
 
 
160 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.9 
 
 
159 aa  176  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.17 
 
 
159 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.36 
 
 
159 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.11 
 
 
159 aa  114  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  36.99 
 
 
164 aa  97.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  30.92 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  34.25 
 
 
167 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
152 aa  84.3  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  31.91 
 
 
574 aa  81.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.76 
 
 
216 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  34.51 
 
 
572 aa  80.5  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  32.41 
 
 
185 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  29.3 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  28.33 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
393 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.51 
 
 
575 aa  77.8  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  29.81 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  28.33 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  31.33 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  34 
 
 
162 aa  77  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  32.39 
 
 
579 aa  74.7  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  33.56 
 
 
575 aa  74.7  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.51 
 
 
574 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.8 
 
 
582 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.8 
 
 
575 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.8 
 
 
575 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  33.33 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  31.54 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  34.01 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  31.54 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  31.54 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  31.54 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  31.54 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.13 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  31.54 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.69 
 
 
575 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  31.54 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.61 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.29 
 
 
311 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  33.8 
 
 
574 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  34.75 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.53 
 
 
573 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  33.33 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  30.72 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  33.33 
 
 
313 aa  70.9  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.85 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  31.91 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.82 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.59 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  29.85 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.86 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  32.61 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  29.01 
 
 
570 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  30.57 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  32.2 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  30.99 
 
 
576 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  29.79 
 
 
584 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  32.71 
 
 
320 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  31.21 
 
 
430 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  34.91 
 
 
309 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.71 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  28.24 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  37.38 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  32.48 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  29.13 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  32.56 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.34 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.94 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  28.17 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0578  putative reductase  35.48 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.637649  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  34.48 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  34.48 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  25.69 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  32.56 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  31.69 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  34.48 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  33.33 
 
 
582 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  33.09 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>