More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2671 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  84.15 
 
 
285 aa  461  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  72.89 
 
 
284 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  79.57 
 
 
296 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  69.37 
 
 
284 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  69.37 
 
 
284 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  60.07 
 
 
284 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  61.29 
 
 
290 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  59.72 
 
 
284 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  59.36 
 
 
284 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  56.89 
 
 
284 aa  358  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  55.83 
 
 
284 aa  350  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  58.1 
 
 
284 aa  349  3e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 
284 aa  341  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  54.93 
 
 
284 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  54.93 
 
 
284 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 
289 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  50.36 
 
 
296 aa  292  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 
288 aa  291  6e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
287 aa  291  8e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
292 aa  288  8e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 
288 aa  281  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 
309 aa  281  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
287 aa  272  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
285 aa  269  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  47.87 
 
 
296 aa  268  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  43.01 
 
 
284 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  46.89 
 
 
283 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  47.2 
 
 
286 aa  260  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  48.43 
 
 
286 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  48.43 
 
 
286 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  42.55 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  42.91 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  42.2 
 
 
284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  46.57 
 
 
285 aa  251  8.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  45.62 
 
 
300 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 
285 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  44.56 
 
 
287 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 
299 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  44.24 
 
 
300 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  43.93 
 
 
282 aa  248  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  43.93 
 
 
282 aa  247  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 
289 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  46.1 
 
 
307 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 
310 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
291 aa  245  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  43.66 
 
 
287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  44.28 
 
 
297 aa  242  5e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  43.53 
 
 
282 aa  241  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 
288 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  45.36 
 
 
283 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  44.48 
 
 
283 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  48.73 
 
 
297 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  42.86 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  44.33 
 
 
304 aa  239  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  42.5 
 
 
284 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  44.96 
 
 
280 aa  239  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  44.24 
 
 
282 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  48.19 
 
 
295 aa  238  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  45 
 
 
283 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  42.86 
 
 
289 aa  237  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  43.9 
 
 
288 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 
284 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  47.83 
 
 
295 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  44.06 
 
 
286 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  43.46 
 
 
287 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  46.4 
 
 
302 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  44.01 
 
 
282 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  43.66 
 
 
283 aa  236  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  43.57 
 
 
282 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 
281 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  41.49 
 
 
282 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  44.6 
 
 
283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  43.16 
 
 
287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  42.31 
 
 
289 aa  235  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  45.2 
 
 
282 aa  234  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  44.72 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  44.24 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  44.6 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  42.51 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  42.96 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  43.57 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  43.57 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  42.16 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  44.6 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  43.57 
 
 
283 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  43.57 
 
 
283 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  43.57 
 
 
283 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  46.29 
 
 
291 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  42.86 
 
 
283 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  44.8 
 
 
287 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1002  formyltetrahydrofolate deformylase  44.37 
 
 
288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  41.58 
 
 
294 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  43.57 
 
 
283 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  43.42 
 
 
283 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>