More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0869 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.85 
 
 
479 aa  751    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.59 
 
 
479 aa  742    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  82.85 
 
 
481 aa  833    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.54 
 
 
480 aa  813    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.87 
 
 
489 aa  867    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  92.29 
 
 
480 aa  919    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  976    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.01 
 
 
479 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.12 
 
 
479 aa  724    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.33 
 
 
480 aa  810    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.38 
 
 
479 aa  746    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.79 
 
 
477 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3968  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.13 
 
 
476 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3920  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.7 
 
 
476 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1927  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.64 
 
 
475 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0099  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.07 
 
 
476 aa  569  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.95 
 
 
478 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3171  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.08 
 
 
476 aa  564  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30113  lipoamide dehydrogenase  53.43 
 
 
543 aa  502  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15203  predicted protein  55.19 
 
 
462 aa  493  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000969694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 
475 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.54 
 
 
465 aa  277  2e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.75 
 
 
463 aa  277  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.48 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.97 
 
 
458 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 
469 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.39 
 
 
585 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.11 
 
 
467 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.16 
 
 
467 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
465 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.86 
 
 
463 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.98 
 
 
472 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.27 
 
 
462 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.18 
 
 
473 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  36 
 
 
466 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.94 
 
 
476 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.29 
 
 
462 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.05 
 
 
462 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.94 
 
 
476 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.74 
 
 
465 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.96 
 
 
468 aa  258  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 
476 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.58 
 
 
476 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.89 
 
 
459 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.93 
 
 
467 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.85 
 
 
466 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.52 
 
 
466 aa  257  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.49 
 
 
479 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.13 
 
 
473 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 
476 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 
476 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 
476 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 
470 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 
470 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 
470 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.03 
 
 
459 aa  256  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
470 aa  256  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
470 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.22 
 
 
492 aa  256  8e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
470 aa  256  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.04 
 
 
602 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.52 
 
 
593 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.33 
 
 
458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.52 
 
 
476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.26 
 
 
470 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.21 
 
 
468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.56 
 
 
464 aa  254  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.4 
 
 
470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.16 
 
 
473 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.52 
 
 
476 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.52 
 
 
476 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.52 
 
 
476 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.52 
 
 
476 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.31 
 
 
476 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.95 
 
 
473 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.23 
 
 
463 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 
481 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.4 
 
 
462 aa  252  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 
474 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.73 
 
 
476 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
465 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.08 
 
 
466 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.79 
 
 
466 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.31 
 
 
476 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.96 
 
 
466 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.74 
 
 
473 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.1 
 
 
476 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.77 
 
 
470 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.1 
 
 
476 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.84 
 
 
470 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.07 
 
 
467 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.88 
 
 
466 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.58 
 
 
475 aa  250  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.29 
 
 
470 aa  250  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.61 
 
 
477 aa  249  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.82 
 
 
466 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>