More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3654 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  100 
 
 
489 aa  1013    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  36.03 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  34.23 
 
 
510 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  35.81 
 
 
478 aa  240  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  32.05 
 
 
492 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  35.28 
 
 
457 aa  230  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  32.99 
 
 
470 aa  220  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  33.33 
 
 
631 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  32.22 
 
 
517 aa  213  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  32.92 
 
 
553 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  31.55 
 
 
517 aa  209  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  30.02 
 
 
500 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  30.08 
 
 
470 aa  209  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  31.28 
 
 
471 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  32.96 
 
 
490 aa  205  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  32.13 
 
 
491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  32.68 
 
 
484 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  32.56 
 
 
522 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  33.48 
 
 
479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  30.21 
 
 
452 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  31.84 
 
 
637 aa  196  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  32.51 
 
 
457 aa  196  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.23 
 
 
486 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  32.48 
 
 
462 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  30.58 
 
 
724 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  30.9 
 
 
472 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  30.04 
 
 
495 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  32.44 
 
 
543 aa  189  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  32.59 
 
 
458 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  30.42 
 
 
442 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  30.7 
 
 
457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  30.59 
 
 
462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  29.9 
 
 
548 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  31.12 
 
 
559 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  31.51 
 
 
438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  32.6 
 
 
491 aa  183  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  31.62 
 
 
539 aa  183  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  30.53 
 
 
513 aa  182  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  30.82 
 
 
487 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  30.62 
 
 
440 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  30.35 
 
 
481 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  30.53 
 
 
497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  29.65 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  29.67 
 
 
474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  28.85 
 
 
467 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  28.51 
 
 
497 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.32 
 
 
480 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  30.17 
 
 
519 aa  171  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.41 
 
 
482 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  31.5 
 
 
453 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  28.51 
 
 
442 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  28.95 
 
 
453 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  31.39 
 
 
440 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  28.26 
 
 
562 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  27.99 
 
 
551 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  25.82 
 
 
533 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  27.24 
 
 
541 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.37 
 
 
466 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.95 
 
 
497 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  29.06 
 
 
493 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  27.83 
 
 
609 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  29.03 
 
 
460 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.32 
 
 
497 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  28.45 
 
 
481 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.32 
 
 
497 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.32 
 
 
497 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  28.39 
 
 
480 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  25.69 
 
 
535 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  25.69 
 
 
535 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.36 
 
 
501 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  25.69 
 
 
535 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  30.38 
 
 
465 aa  156  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  26.4 
 
 
554 aa  156  7e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  26.46 
 
 
486 aa  156  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  28.63 
 
 
500 aa  156  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  29.62 
 
 
497 aa  156  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  27.48 
 
 
553 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  26.35 
 
 
523 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  27.35 
 
 
627 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  27.42 
 
 
596 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  29.02 
 
 
489 aa  154  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  29.54 
 
 
462 aa  154  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  25.89 
 
 
578 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.31 
 
 
497 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  27.49 
 
 
542 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  28.91 
 
 
453 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  28.32 
 
 
483 aa  150  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  28.68 
 
 
489 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  28.78 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  25.59 
 
 
563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  28.54 
 
 
506 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  27.76 
 
 
507 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  29.61 
 
 
638 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  27.41 
 
 
536 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  28.29 
 
 
479 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  28.51 
 
 
468 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  27.16 
 
 
506 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  27.61 
 
 
551 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  25.63 
 
 
543 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  26.02 
 
 
558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>