More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1413 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  76.12 
 
 		 402 aa  660    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  100 
 
 		 402 aa  825    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  30.03 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  29.29 
 
 		 395 aa  130  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  31.14 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  31.31 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  31.74 
 
 		 407 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  29.76 
 
 		 403 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  28.96 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  28.61 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  27.74 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  33.11 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  29.55 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 779 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  27.45 
 
 		 779 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  30.23 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.26 
 
 		 780 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  29.92 
 
 		 631 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  28.36 
 
 		 580 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  28.91 
 
 		 704 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1676 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  31.35 
 
 		 441 aa  93.2  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  29.59 
 
 		 653 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.89 
 
 		 865 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.22 
 
 		 875 aa  89.7  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  24.62 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 661 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  27.72 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  23.93 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  26.21 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  25.84 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  25.09 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  23.74 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  22.85 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  25.31 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  28.64 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 275 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 267 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 268 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 268 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  35.9 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  34.58 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  32.04 
 
 		 268 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 422 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  35 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  34.91 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  33.96 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  21.45 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  29.57 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  25.93 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  34 
 
 		 287 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.9 
 
 		 255 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 264 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 285 aa  57  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 285 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.08 
 
 		 232 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  32.54 
 
 		 197 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 208 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  36.27 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 250 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  34.71 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 258 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.62 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  33.62 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  33.62 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  33.62 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  33.62 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  33.04 
 
 		 258 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  33.62 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.17 
 
 		 253 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  33.62 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 218 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  33.62 
 
 		 261 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>