138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12103 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  840    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  27.24 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  30.69 
 
 
407 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  25.46 
 
 
399 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  25.13 
 
 
395 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  23.86 
 
 
399 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  26.95 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  29.58 
 
 
631 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  27.83 
 
 
580 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  26.62 
 
 
400 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  27.12 
 
 
403 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  29.05 
 
 
360 aa  92.8  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  25.77 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  27.6 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  28.31 
 
 
441 aa  87  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  26.92 
 
 
779 aa  86.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  28.69 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  26.07 
 
 
653 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 
779 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  30 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  27.46 
 
 
704 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  28.57 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.51 
 
 
865 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.4 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 
661 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.12 
 
 
1676 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  24.05 
 
 
780 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  23.73 
 
 
439 aa  76.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.36 
 
 
875 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  28.69 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  29.96 
 
 
359 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  27.02 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  27.89 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  23.23 
 
 
441 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  23.23 
 
 
441 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  21.76 
 
 
440 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.02 
 
 
447 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
273 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  29.9 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  28.87 
 
 
265 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  32.74 
 
 
283 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
249 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.81 
 
 
296 aa  53.1  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
270 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
250 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
250 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
267 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
250 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  31.37 
 
 
332 aa  49.7  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  32.99 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  34.02 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  27.4 
 
 
208 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
250 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
250 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.99 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  32.17 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.65 
 
 
250 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
246 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  28.99 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  28.99 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  28.99 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  28.99 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
250 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  28.99 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  28.99 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  28.99 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 
268 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.44 
 
 
244 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1509  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.32 
 
 
424 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.67 
 
 
228 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
253 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  26.32 
 
 
291 aa  46.6  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
276 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  31.11 
 
 
285 aa  46.6  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  33 
 
 
256 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1058  methyltransferase, putative  27.37 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
248 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
246 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  29.73 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  27.27 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.31 
 
 
209 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  30.32 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
243 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.48 
 
 
210 aa  45.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0814  methyltransferase, putative  27.37 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.638021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.73 
 
 
256 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.73 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
250 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
275 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
272 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
272 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 
258 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  24.09 
 
 
267 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
210 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>