More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2366 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 451 aa  904    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  51.75 
 
 		 457 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  49 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  51.52 
 
 		 484 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  49.44 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  51.79 
 
 		 457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  47.91 
 
 		 453 aa  451  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 		 454 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  44.96 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  47.78 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  51.64 
 
 		 453 aa  443  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  47.11 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  48.48 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  47.32 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  50.71 
 
 		 454 aa  435  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  49.16 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  47.75 
 
 		 452 aa  435  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  49.16 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  48.01 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  49.06 
 
 		 470 aa  435  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  48.93 
 
 		 457 aa  433  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  47.11 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  47.78 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  47.22 
 
 		 448 aa  435  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  47.44 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  47.34 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  47.77 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  46.58 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  44.49 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  46.52 
 
 		 461 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  44.85 
 
 		 520 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  46.31 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  47.17 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  46.02 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  45.39 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  46.48 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  46.33 
 
 		 489 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  44.37 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  44.11 
 
 		 514 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  46.04 
 
 		 507 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  44.11 
 
 		 514 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  46.15 
 
 		 465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  44.1 
 
 		 457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  46.4 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  46.3 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  46.93 
 
 		 474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2597  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  45.56 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  45.03 
 
 		 462 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  46.79 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  47.38 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  44.91 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  48.86 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  44.98 
 
 		 518 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  46.94 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  46.94 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  46.94 
 
 		 476 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  44.64 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  43.14 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4631  DNA repair protein RadA  46.83 
 
 		 477 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.742671  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  45.51 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  46.98 
 
 		 443 aa  398  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2015  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.086129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  48.15 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2454  DNA repair protein RadA  47.6 
 
 		 483 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.819464  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2284  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  43.11 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2291  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 		 482 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  42.32 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3499  DNA repair protein RadA  49.3 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3789  DNA repair protein RadA  49.07 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  44.22 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  44.16 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  46.61 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  46.8 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  44.84 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  46.87 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  44.22 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  44.22 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  44.63 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  46.64 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  44.22 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  44.22 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  44.16 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  45.92 
 
 		 451 aa  395  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  43.14 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>