More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4567 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  323  7e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  73.72 
 
 		 157 aa  245  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 155 aa  239  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  67.31 
 
 		 161 aa  215  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  66.89 
 
 		 164 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  64.74 
 
 		 166 aa  213  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  66.67 
 
 		 166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 166 aa  208  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 166 aa  207  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 166 aa  204  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 166 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 176 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  57.24 
 
 		 160 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  57.33 
 
 		 170 aa  170  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 170 aa  167  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 180 aa  167  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  53.47 
 
 		 156 aa  157  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  53.47 
 
 		 156 aa  157  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 156 aa  157  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  49.03 
 
 		 155 aa  153  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  50.67 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  47.1 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  49.33 
 
 		 175 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  48 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  48.34 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  48.34 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  48.34 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  48.34 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  47.02 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  40.74 
 
 		 175 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  40.74 
 
 		 175 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  40.74 
 
 		 175 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  40.74 
 
 		 175 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  45.83 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  40.76 
 
 		 229 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 202 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  40.74 
 
 		 229 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 155 aa  131  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.83 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.11 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 		 175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40.12 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 213 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>